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末端氨基的分析，是鉴定蛋白质纯度的方法之一。一条肽链的蛋白质，通过N-末端的定量分析，每克分子蛋白质应当有整数克分子的N-末端氨基酸，少量其他末端氨基酸的存在，常常表示存在有杂质。
分析蛋白质各种氨基酸百分比，也可作为蛋白质各类鉴定的参考值。
最终的纯度标准，应当是氨基酸顺序的测定。
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