HA0分子水解为HA1和HA2两条多肽链是决定病毒有无感染性的先决条件。各亚型病毒HA 蛋白裂解位点的氨基酸组成不同,如人H1、H2及H3型病毒HA蛋白的裂解位点只有一个单独的精氨酸残基(R)。而另外一些病毒的HA蛋白,特别是禽流感病毒HA蛋白的裂解位点则有数个碱性氨基酸。根据对禽H5及H7 HA蛋白的研究发现,非致病性病毒HA蛋白的裂解位点含有1~2个碱性氨基酸,其序列呈R-X-X-R/K(X为其他非碱性氨基酸残基);而致病性HA蛋白的裂解位点至少由4个碱性氨基酸残基组成,其序列为 R-E-R-R-R-K-K-R。
人流感病毒用鸡胚分离培养时无需加入外源性胰酶,因为鸡胚组织细胞产生的蛋白酶可水解病毒的HA0蛋白,使其具有感染性,但用哺乳类动物细胞(如MDCK)培养时需加入外源性胰酶以协助病毒HA0分子水解。