碱裂解或碱提取是分子生物学中用于从细菌中分离质粒DNA的方法。
方法
首先，含有感兴趣质粒的细菌被培养，随后通过离心浓缩细胞物质（包括DNA）至容器底部形成一个沉淀物。上清液被弃去，然后将沉淀物重新悬浮在含有EDTA的生理缓冲液中。EDTA的作用是与二价金属阳离子如镁离子和钙离子结合，这些离子对于DNA降解酶（DNases）的功能至关重要，同时也有助于稳定DNA磷酸基团骨架和细胞壁。缓冲液中的葡萄糖将维持细胞的渗透压，以防止细胞破裂。在缓冲液中加入三羟基尿素将保持细胞的pH值为8.0，而RNA酶将去除RNA，这将破坏实验。
此外，还准备了一种强碱性溶液，该溶液由洗涤剂十二烷基硫酸钠（SDS）和一种强碱如氢氧化钠（NaOH）组成，并随后加入。所得混合物经过几分钟的培养。在此期间，洗涤剂破坏细胞膜，使碱性物质能够接触并去折叠染色体和质粒DNA。在SDS撕裂细胞膜后，细胞内容物将中和氢氧化钠；这就是为什么溶解pH值从12.8降至12.3的原因。因此，若细菌细胞数量不足，多余的氢氧化钠将用于生成小的DNA片段。然而，0.5M L-精氨酸能够提供稳定的pH值，可用于替代0.1M的氢氧化钠。
最后，加入醋酸钾。此酸化溶液，使得质粒DNA得以再溶，但不包括染色体DNA，后者会从溶液中沉淀出来。钾的另一个功能是促使硫酸钠十二烷基磺酸盐的沉淀，从而去除洗涤剂。最终离心处理完成，这一次形成的沉淀物仅含有杂质，可被丢弃。含有质粒的上清液被小心地移除，可以进一步纯化或用于分析，如凝胶电泳。
其他用途
此外，有时还会使用碱性裂解法来提取植物遗传物质。植物细胞被置于一种强碱性溶液中，该溶液含有洗涤剂（通常为两性或非离子型洗涤剂，如Tween 20），然后在高温下进行培养。由于氢氧化钠对遗传物质的潜在损害性，使得该方法不常被采用，从而降低了DNA片段的大小。
碱裂解法提取质粒dna的原理是：高PH的溶液会使细胞壁粕类从而使得DNA和蛋白质变性。
将细菌悬浮液暴露于高pH值的强阴离子洗涤剂中，会使细胞壁破裂，染色体DNA和蛋白质变性，将质粒DNA释放到上清中。
尽管碱性溶剂使碱基配对完全破坏，闭环的质粒DNA双链仍不会彼此分离，这因为它们在拓扑学上是相互缠绕的。只要用碱处理的强度和时间不要太过，当pH值恢复到中性时，DNA双链就会再次形成。
在裂解过程中，细菌蛋白质、破裂的细胞壁和变性的染色体DNA会相互缠绕成大型复合物，后者被十二烷基硫酸盐包盖。当用K+取代Na+时，复合物会从溶液中有效地沉淀下来，离心除去变性剂后，就可以从上清中回收复性的质粒DNA。
在SDS存在的条件下，碱水解是一项非常灵活的技术，它对E. coli的所有菌株都适用，并且其细菌培养物的体积可以从1-500mL以上。
碱裂解法适用于小量质粒DNA的提取，提取的质粒DNA可直接用于酶切、PCR扩增、银染序列分析。方法如下：
1、接1%含质粒的大肠杆菌细胞于2mlLB培养基。
2、37℃振荡培养过夜。
3、取1.5ml菌体于Ep管(离心管)，以4000rpm离心3min，弃上清液。
4、加0.lml溶液I（1%葡萄糖，50mM/LEDTApH8.0，25mM/LTris-HClpH8.0）充分混合。
5、加入0.2ml溶液II（0.2mM/LNaOH，1%SDS），轻轻翻转混匀，置于冰浴5min。
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