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宏观进化可能以两种方式出现:
一是通过对微观进化过程进行推论。
微小进化在孤立的种群中经历足够时间,最后形成新物种。
二是突然迅速变化。这一理论-间断平衡-由Stephen Jay Gould提出,它基于有机体中存在关键基因的事实(例如homeobox),它们小的变化可产生有机体巨大的变化,并导致新物种迅速形成。