1.尿常规 镜检白细胞增多，若见白细胞(或脓细胞)管型，则提示病变在上尿路。红细胞也可增多，血尿型者甚至为肉眼血尿。尿蛋白可增多，但一般＜2.0g/d，多为小分子蛋白，肾小管功能受损时，可出现尿比重降低，晨尿pH增高。
尿白细胞排泄增加提示尿路炎症，在诊断方面也具有重要意义。无症状菌尿症时脓尿发生率约37%，白细胞排泄＞5个/mm3即属异常。脓尿与菌尿有极显著的相关性，可作为最初的筛选方法。白细胞酯酶试纸法对预测镜下菌尿和阳性尿培养的敏感性均为100%，如再结合镜下脓尿、菌尿，其特异性亦达100%。
用抗生素或化疗药物治疗，不久即可呈现无菌性脓尿。无菌性脓尿也是肾结核、结石、镇痛剂滥用、少数需氧菌和厌氧菌感染的表现。尿路损伤如衣原体尿道炎、肾小球肾炎和肾病等也可见无菌性脓尿。
不伴脓尿的尿路感染见于药物和再生性障碍等引起的白细胞减少症，肾脏集合系统远端感染性病变(如肾皮质脓肿)，偶见于梗阻性尿路病。
白细胞尿不是尿路感染恒有的特点，连续几次的尿标本白细胞计数变化不定。单次尿标本查不到白细胞不应视为无菌尿的证据。脓尿取决于尿液流量和尿pH值。一天之内尿细菌计数也可不同，一般来讲，宜查晨尿标本。
白细胞管型是上尿路炎症性疾病可靠的证据，但与颗粒管型一样并非感染所特有。活动性肾盂肾炎时常见不到这些管型。做管型计数时须用新鲜尿标本。
镜下血尿不是提示细菌感染的可靠证据。无蛋白尿不能排除尿路感染，大多数尿路感染病人尿蛋白排泄低于2.0g/24h。
2.尿细菌检查 有意义菌尿是指径直接取得(膀胱穿刺)的膀胱尿证实有细菌繁殖(不管计数多少)或取中段尿培养计数大于105/ml。当有尿路梗阻、频繁排尿，标本采取不当以及使用抗生素时均可影响培养结果。但如连续3次均得到相同的结果时，其诊断价值将从单次的80%增加到95%以上。尿菌定量培养结果评定标准是尿含菌数大于105/ml为阳性，小于104/ml为污染，介于104～105/ml之间需复查或结合临床综合考虑作出诊断。但球菌繁殖速度较慢，尿含菌数达103～104/ml，已有诊断意义。根据临床需要，除作普通菌培养外，高度怀疑原浆型菌株可作高渗培养，这可提高L型菌株培养阳性率。对多次尿普通菌培养阳性的慢性肾盂肾炎的诊断有重要意义。L型细菌是没有固体细胞壁的细菌。细菌接触到损伤其表面的物质，如抗生素或抗体-补体-溶菌酶后可转变成L-型细菌。肾髓质的高张力状态有利于其存活。L-型细菌毒力较低，转为正常细菌后毒力可恢复正常。必要时尚可作厌氧菌培养，真菌培养。培养阳性时应作药物敏感试验，以指导临床选择抗菌药物，不离心尿若直接镜检发现每个高倍镜下有1个细菌，对判断有意义菌尿也有100%的特异性和78%的敏感性。本法简便，阳性率高，并可确定是杆菌抑或球菌，是革兰阳性抑或阴性，这对及时选用有效药物治疗很有参考价值。
尿液标本留取的方法直接影响诊断的准确性，晨起第1次中段尿仍有首选方法，其次为导尿法和耻骨上膀胱穿刺取尿，但40%～60%的老年人存有轻重不一的尿失禁，可采用外套管收集标本，该方法与导尿法比较有100%的敏感性和94%的特异性。标本留取后不立即培养时应置入冰箱保存。尿标本在室温放置2h以上细菌即可增殖。
3.尿细胞计数 近年多应用1h尿细胞计数法，其评判标准为白细胞30万/h为阳性，小于20万/h为阴性，介于20万～30万/h需结合临床判断。尿细胞计数常用于本病慢性期，尤其尿常规无明显异常，多次尿培养无阳性结果，又无特异临床表现者。
4.血常规检查 急性期血白细胞计数和中性粒细胞可增高，慢性期红细胞计数和血红蛋白可轻度降低。
5.血清学检查 较有临床意义的为：①尿抗体包裹细菌检查，在荧光镜下观察用荧光素标记的抗人体蛋白抗体处理的尿细菌，若表面有抗体包裹则大多属于肾盂肾炎，有助于尿路感染的定位诊断；②鉴定尿细菌的血清型，有助于区分再发性肾盂肾炎的性质，若再发时与前次为同一血型则属复发，而2次为不同血清型者为重新感染。
6.肾功能检查 慢性期可出现持续性功能损害：①肾浓缩功能减退如夜尿量增多，晨尿渗透浓度降低；②肾酸化功能减退如晨尿pH增高，尿HCO3－增多，尿NH4＋减少等；③肾小球滤过功能减退如内生肌酐清除率降低，血尿素氮、肌酐增高等。
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