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质谱仪的主要组成之一,实现样品离子化的区域。由电离室、离子束的加速场、聚焦透镜等构成。它的作用是使被分析物电离,变成分子离子或碎片离子。离子源的种类很多,主要有电子电离源(EI)、化学电离源(CI)、射频火花源(RFS)、电感耦合等离子体离子源(ICP)、场致电离源(FI)、场解吸电离源(FD)、快原子轰击源(FAB)、激光解吸电离源(LD)、热喷雾电离源(TS)、电喷雾电离源(ESI)等。