埃可病毒是引起出疹性发热主要的病原。以中枢神经系统感染最常见，呼吸道感染也多见。各种不同亚型的病毒可引起不同的症状表现。
1.无菌性脑膜炎
是最常引起的中枢神经系统疾病，除埃可24，26，29和32型病毒外均可引起脑膜炎，病程一般为7～10天，以埃可4，6，9，11，16和30型病毒为最常见，既可引起散发性发病，也可引起暴发流行，埃可2～7，11，14～19，25，30，31和33型病毒曾从脑脊液或其他肠道外来源被分离出。
2.脑炎
埃可2～4、6、7、9、11、14、16、18、19和30型病毒均可引起脑炎症状类似于乙型脑炎，埃可4、6、9、30型病毒尤为常见，其中2，6，9，17和19型曾从脑脊液或其他肠道外来源分离。
3.瘫痪性疾患
埃可1～4、6、7、9、11、14、16、18、19、30型病毒皆可引起类似于脊髓灰质炎的瘫痪性疾患，但肌肉瘫痪程度较轻，恢复快而完全，其中4，6，9，11，16，19，30型曾从脑脊液或其他肠道外来源分离。
4.出疹性发热
埃可病毒是引起出疹性发热主要的病原，皮疹的发病原理还未明了，尚未有报告从斑丘疹和瘀斑中分离出病毒，因此还不清楚是病毒本身所引起或由免疫机制所致，目前诊断主要依靠从疱疹，血液，粪便或咽部分泌物中分离病毒。
肠道病毒性皮疹可作为埃可病毒在人群中流行的标志，由于容易和一些重要的发疹性传染病相混淆而需要加以鉴别，因此，可按其模拟的疾病而分类。
（1）风疹或麻疹样皮疹 埃可9型病毒是最常见与风疹样皮疹相关的病毒，表现为细小的斑丘疹，在夏季流行，皮疹特征为与发热同时出现，首先发生于面部（所有病例），然后蔓延到颈部（75%），胸部（64%）和四肢（56%），疹子数量极多，粉红色，直径1～3毫米，不痒不脱屑，与风疹极为相似，埃可2，4，11，19和25型病毒也曾引起多个小型暴发流行。
（2）蔷薇疹样皮疹 埃可16型病毒所引起蔷薇疹样皮疹特征不在于外表，而在于出现时间，这种皮疹要到热退以后才出现，一般体温在38℃～39℃之间，持续24～36小时，退热后即出现稀疏，不痒的，粉红色斑疹和丘疹，直径0.5～1.5毫米，先发生在颜和上胸部，四肢较少见，皮疹持续1～5天后消退，出疹时间并非固定不变，由埃可16型病毒引起的皮疹也可与发热同时出现，埃可11，15型病毒也可引起类似临床表现。
（3）疱疹样皮疹 埃可11型病毒可引起全身性疱疹样皮疹，除具有手，足，口腔病特征外，疱疹分批出现于头部，躯干和四肢，不发展成脓疱，也不结痂，可发生于免疫抑制的成年人，此外，曾有埃可6型病毒可引起类似于带状疱疹的皮疹，并从大疱中分离出该病毒的报道。
（4）瘀点样皮疹和其他皮肤表现 埃可9型病毒可引起瘀点和瘀斑，并容易和流行性脑膜炎相混淆，特别当无菌性脑膜炎同时存在时。
5.急性胃肠炎
许多埃可病毒，特别是11，18，22以及1，3，6，9，14，19型，可引起小儿急性胃肠炎，表现为疲乏与腹泻，水样便，24小时后有寒战，呕吐，腹痛和肌痛，48小时内可有发热，大便稀薄带水，呈黄色或黄绿色，混有小量黏液，偶尔带血，每日排便5～6次至10余次不等，临床上一般不出现脱水症状，于48小时内迅速恢复，仅个别患儿的病情较严重，出现脱水，酸中毒等症状，在咽洗液，血及粪内可分离出病毒，但排毒时间大多短暂（不超过36小时）。
6.呼吸道感染
埃可4、7、20和25型病毒可引起流感样症状表现；19、20型病毒在儿童中可引起肺炎；9型病毒在成人中可引起支气管肺炎。
7.心肌炎与心包炎
埃可1、4、6、8、9、14、19、22、25、30型病毒都可引起急性心肌炎和心包炎。
8.流行性胸痛
埃可6、9、25～32型病毒可引起流行性胸痛。
9.非特异性发热
埃可1～8、11～34型病毒引起可引起非特异性发热。
10.其他
埃可4，9型病毒可引起肝炎，9型亦可引起睾丸炎；埃可4，9，16，20型病毒可引起淋巴结炎。
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