长期以来，万古霉素是治疗MRSA感染的金标准。1996年日本首次报道了万古霉素不敏感株Mu3。2002年美国报道首例万古霉素耐药株（VRSA），此后全球报道万古霉素株或耐药MRSA不断增多。迄今己报道VISA超过100株，VRSA16株。针对以上情况，新的抗MRSA感染药物的研发已取得不少进展，如利奈唑胺、达托霉素、替加环素、特拉万星、头孢洛林等。体外药敏试验结果显示，这些新的抗MRSA药物具有良好抗菌活性，正在被临床验证中。
2011年1月4日，美国感染病学会（IDSA）在线发布了首个耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）感染治疗指南，该指南经美国儿科感染病学会、美国急救医师协会及美国儿科学会审核、认可。
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