成人患者：在最初14天，奈韦拉平的推荐剂量为每日1片，每片200 mg（这一导入期的应用可以降低皮疹发生率）。导入期后用法为每日2次，每次1片，并同时使用至少两种以上的其他抗逆转录病毒药物。对于那些合用药，应遵循其推荐剂量并且应对这些药物进行监控。
儿童患者：对于2个月到8岁的儿童，本药的口服推荐剂量是用药初始2周按4 mg/kg，一天1次给药，之后为7 mg/kg，一天2次给药。对于8岁和8岁以上的儿童患者，推荐剂量为初始2周按4 mg/kg，一天1次，之后为4 mg/kg，一天2次。任何患者每日用药总剂量不得超过400 mg。
预防HⅣ母婴传播：对于将马上分娩的孕妇，本药的推荐剂量是口服单剂量200 mg，新生儿在出生后72小时内，按2 mg/kg单剂量口服用药。
若患者在用药期间出现严重皮疹或伴随全身症状的皮疹，应该停药。如果在导入期14天内，剂量为200 mg/天时出现皮疹，则患者的用药剂量不再增加，直至皮疹消失。
如果患者出现中度或重度肝功能异常（不包括GGT），应停止使用奈韦拉平，直至肝功能恢复至基础水平。之后，奈韦拉平应从200 mg/天重新开始给药，进一步观察，然后谨慎地增加剂量到200 mg/次，每日2次。如果再次出现中度或重度肝功能异常，奈韦拉平应该永久停药。
如果患者停用奈韦拉平超过7天，应按照给药的原则重新开始，即200 mg药物，每日1次导入，之后每次200 mg，每日2次。
用药过量尚无已知的奈韦拉平解毒药。有报道过量使用奈韦拉平剂量每日800-1800 mg长达15天，患者出现水肿、结节性红斑、乏力、发热、头痛、失眠、恶心、浸润性肺炎、皮疹、眩晕、呕吐和体重下降。在停用奈韦拉平后均好转。
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