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加州大学戴维斯分校的Uri Keshet在ASMS会议上讨论代谢组学的挑战与机遇

2024.6.03
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柔荑含莲

听君一席话,胜读十年书

加利福尼亚州阿纳海姆——在2024年6月2日至6日即将举行的ASMS会议中,加州大学戴维斯分校的Uri Keshet将展示他对13,700份人类血浆样本的代谢组学研究,这些样本来自TEDDY队列,一个专注于年轻人糖尿病环境决定因素的研究项目。作为UC Davis Genome Center - Metabolomics的技术总监,Keshet面临的主要挑战是如何快速有效地处理和分析大量数据,以及如何开发高通量采集方法来应对约60,000次注射的需求。


代谢组学作为一种非目标性的分析方法,旨在尽可能广泛地覆盖新陈代谢过程,这使得数据获取、处理和分析变得尤为复杂。与传统的目标性分析不同,代谢组学需要处理大量未知的、可能受多种因素影响的代谢物,这要求开发新的数据处理方法以确保结果的准确性和可比性。

在此背景下,LC-MS/MS技术因其高吞吐量和改进的MSMS采集质量而成为代谢组学研究的首选工具。与传统的GCMS相比,LCMS技术能够更快地进行分离,提高分析效率,从而更好地满足大型代谢组学研究的需求。

在这项研究中,Keshet意外发现,使用高分辨率质谱法进行色谱分离时,几乎没有损失在任何检测到的特征上,这一结果超出了预期。此外,柱子和仪器的表现也超出预期,能够接受各种样本并保持高流速和高采集率。

展望未来,Keshet表示,研究的下一步将侧重于定量标准化和化合物鉴定,以进一步提高代谢组学数据的质量和可靠性。他对于即将到来的ASMS会议充满期待,希望通过这次会议与来自世界各地的新老朋友交流,促进学术合作。

Uri Keshet的报告不仅展示了他在代谢组学领域的研究成果,也为未来的研究方向提供了宝贵的见解。他对于即将到来的ASMS会议充满期待,这表明了学术交流在推动科学进步中的重要作用。

在这份报告中,我们看到了代谢组学作为一个新兴领域所面临的挑战,同时也看到了随着技术的进步,特别是LC-MS/MS技术的发展,这些挑战正在逐步被克服。随着定量标准化和化合物鉴定的进一步研究,代谢组学有望为糖尿病等疾病的早期诊断和治疗提供更多的线索。


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