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pH Selector 使用说明

ACDLabs CN
2022.3.22

作者 ACD

TA的动态

引言

ACD/pH Selector是同时预测多结构logD曲线的工具。通过研究多目标结构的logD与pH的变化曲线,可以帮助用户更科学地制定前期的筛选策略。本文着重于pH Selector界面的介绍,有关预测结果的解读请见pH-logD曲线在HPLC分析方法开发过程的应用策略(

打开软件

在开始菜单栏下的ACDLabs文件下找到PhysChem History并

软件打开后的界面如下图所示,首先用户需要在Options下的Calculation中对预测算法进行设定。推荐的算法是GALAS,如果用户想了解该算法的具体内容可以

在作图界面用户需要录入所有的目标结构。录入完结构后,

注意:如果结构中有手性异构体,其logD是一样的。软件只会显示其中一个结构的pH-logD曲线图。

下图是软件预测后的界面,用户需要

预测结果界面说明

结构显示窗口

用户可以使用导航按钮或将鼠标悬停在Structure IDs图例中的ID上,在不同结构之间切换。

pH-logD曲线图

用户可以利用pH-logD曲线图获取有用信息,横坐标是pH值,纵坐标为logD。如果用户发现横坐标的pH值不是0-14,勾选上Show Full pH Range即可。用户也可以勾掉Structure IDs中的某些结构让其不显示在logD叠图中。在LogD曲线图中,所选结构的曲线以粗体显示。

图中的不同颜色根据下图的规则行进显示。绿色区域代表的是所有结构离子化状态占比在0-10%时对应的pH范围,橙色区域代表的是所有结构离子化状态占比在10-25%时对应的pH范围,红色区域代表的是所有结构离子化状态占比在25-50%时对应的pH范围。用户可以根据研究目标结构的数量有选择性的利用这些信息。

其中在叠图中还有四条黑色的竖线,一般默认是4条,用户可以通过如下窗口对黑线的条数进行调整。软件放置四条黑线的原则是尽量远离红色区域并让彼此距离最大,可以人为调整黑线放置的位置。用户在分析pH-logD叠图时可以不用考虑黑线对应的pH值。

离子形态曲线

横坐标为pH值,纵坐标为百分比,表示的是选定结构在不同pH值下的微观状态以及不同微观状态所占比例。其中不同的颜色的曲线代表的是对应的微观离子所带电荷情况及存在状态。通常在分析pH-logD图时,不太关注该曲线图。如果需要利用物质不同带电荷状态解决分离问题,建议在Percepta中的pKa预测模块中分析。

色谱柱列表

该列表不是软件在推荐色谱柱,而是提供不同色谱柱的pH值耐受情况。可以

log D Table

表中以0.5个pH值为单位显示了所有结构在不同pH值下具体的logD数值大小。不同的颜色与pH-logD图中的颜色保持一致。

往期回顾

01

pH-logD曲线在HPLC分析方法开发过程的应用策略

02

如何对齐pH selector的logD和Percepta logD的纵坐标

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