人类代谢数据库（HMDB，https://hmdb.ca）是最大、最全面的生物体特异性代谢数据库。该数据库包含或链接了三种数据：化学数据、临床数据和分子生物学/生物化学数据。目前，该数据库包含220945个代谢物条目，包括水溶性和脂溶性代谢物。此外，还包含了8610个和这些代谢条目有关的蛋白质序列（酶和转运蛋白）。
每个代谢物条目里包含物质的分子量、结构、分子式、分类、生物学作用、生理浓度、组织位置、疾病和遗传关联、化学和酶促反应、代谢途径和参考图谱等信息。还有超链接能够连接到其它数据库，包括KEGG、PubChem、MetaCyc和ChEBI等。
为了满足代谢组学研究中不断变化的需求，自2007年首次发布以来，HMDB一直在快速地扩大和更新，如今已更新到5.0版本。
HMDB数据库也是我们鹿明用于LC-MS非靶代谢组学物质鉴定的主要公共数据库之一，也是代谢物信息查询最重要的数据库之一。如何使用HMDB数据库？重要的信息有哪些？跟着小编一起学习下吧~
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根据报告，在HMDB数据库上查找物质信息
拿到代谢组学数据结果后，老师们若想了解代谢物的更多信息，可以通过HMDB数据库查询，包括一些分子式、分子量、CAS号、物质分类等信息。具体操作如下：
1. 首先从项目报告中数据矩阵找到代谢物的Compound ID（以HMDB开头的为HMDB数据库的代谢物号）；
2. 然后将该ID号输入到HMDB网站的问询栏中，就会出现该物质的相关信息。
以Xanthosine（HMDB0000299）为例：
（1）首先可以获取基本信息：代谢物名称、描述、结构式、分子式、分子量、CAS号等，其中代谢物描述可以重点看下，有助于进一步了解代谢物信息；
（2）然后是代谢物的分类，HMDB对代谢物做了比较详细的分析，可帮助我们进一步对重要代谢物生物学意义进行解析；
（3）HMDB提供了非常全的其他数据库链接，可帮助我们非常方便的访问该代谢物在其他数据库的信息；
（4）提供代谢物在人体中存在的位置、内源/外源，如果是外源物质，还提供了具体来源与哪些物种；
（5）提供了代谢物在人体不同类型样品中的含量信息，基于已发表的文献获取信息；
（6）其他：疾病信息，不够全和新，建议以文献调研结果为准；
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HMDB数据库其它功能介绍
1. Browse
用户可以从Browse的下拉菜单中，根据代谢物、疾病、通路、生物样本、分类、蛋白和反应等信息查找代谢物，或是根据和BMI、年龄和性别等相关查找。
2. Search
老师们在Search栏里可以对目标数据进行搜索，例如一些文本信息、基因和蛋白序列、质谱和NMR的谱图等。只需要点进相应的选项，输入数据。
3、Downloads
老师可以根据需求，下载相应的库。可以下载总库，也可以根据尿液、血清、唾液、脑脊液、粪便、汗液不同样品来源下载库。
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文末看点｜lumingbio
上海鹿明生物科技有限公司多年来，一直专注于生命科学和生命技术领域，是国内早期开展以蛋白组学和代谢组学为基础的多层组学整合实验与分析的团队。目前在多层组学研究已经有了成熟的技术方法，欢迎各位老师前来咨询哦~
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