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超实用工具 | 代谢组学MetaboAnalyst 5.0通路富集分析

麦特绘谱
2022.12.08

通过代谢组学筛选到差异代谢物后如何进行通路分析,代谢组学在线免费通路富集分析工具最新版MetaboAnalyst 5.0,登录在线网址:https://www.metaboanalyst.ca/MetaboAnalyst/home.xhtml一站式完成。

Step. 1

登录Home首页

Step. 2

Step. 3

步骤3可根据筛选到的差异代谢物选择Compound Name, KEGG ID, HMDB ID号,三选一即可,本流程以选择输入类型为化合物名称(Compound Name)进行通路富集分析作示例,复制代谢物名称到如下步骤4的空白处后

Step. 4

第1列物质名称为黄色表示未被数据库匹配的物质,详细情况可

Step. 5

判定匹配的物质名称前勾选上,并

Step. 6

全部黄色的物质View完毕后

Step. 7

下图步骤9的Hypergeometric Test(超几何分布)与Fisher''s Exact Test(费歇尔精确检验) 结果差距不大,此步通常默认参数即可;步骤10根据检测样品信息选择相应物种的数据库,以人Homo sapiens(KEGG) 示例下拉

Step. 8

Step. 9

如需生成TIFF或PDF等指定格式的通路富集分析图请执行步骤12和13操作,如对格式无特殊要求可忽略该步骤。

Step. 10

执行下图A-B-C操作

Step. 11

压缩包结果文件说明

MetaboAnalyst 5.0作为代谢组学通用免费通路富集分析工具,深受代谢组学用户认可,你学会了吗?在使用中如有问题欢迎垂询400-867-2686,与我们一起探讨。

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