通过代谢组学筛选到差异代谢物后如何进行通路分析,代谢组学在线免费通路富集分析工具最新版MetaboAnalyst 5.0,登录在线网址:https://www.metaboanalyst.ca/MetaboAnalyst/home.xhtml一站式完成。
Step. 1
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Step. 2
Step. 3
步骤3可根据筛选到的差异代谢物选择Compound Name, KEGG ID, HMDB ID号,三选一即可,本流程以选择输入类型为化合物名称(Compound Name)进行通路富集分析作示例,复制代谢物名称到如下步骤4的空白处后
Step. 4
第1列物质名称为黄色表示未被数据库匹配的物质,详细情况可
Step. 5
判定匹配的物质名称前勾选上,并
Step. 6
全部黄色的物质View完毕后
Step. 7
下图步骤9的Hypergeometric Test(超几何分布)与Fisher''s Exact Test(费歇尔精确检验) 结果差距不大,此步通常默认参数即可;步骤10根据检测样品信息选择相应物种的数据库,以人Homo sapiens(KEGG) 示例下拉
Step. 8
Step. 9
如需生成TIFF或PDF等指定格式的通路富集分析图请执行步骤12和13操作,如对格式无特殊要求可忽略该步骤。
Step. 10
执行下图A-B-C操作
Step. 11
压缩包结果文件说明
MetaboAnalyst 5.0作为代谢组学通用免费通路富集分析工具,深受代谢组学用户认可,你学会了吗?在使用中如有问题欢迎垂询400-867-2686,与我们一起探讨。