近年来，质谱成像技术因其能够直观、快速、简便地呈现出分子在细胞或组织中的结构、空间与时间分布等信息，越来越受到科学家们的关注，被应用到药物前期发现、临床前研究、食品环境、法医鉴定等各领域。
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软件一：MSI Segmentation
快速归类，查看切片空间差异情况
质谱成像数据一般为高分辨质谱数据，有时还有相关物质的离子淌度信息，整体数据所包含的信息量非常大，如何从大量信息中快速找到不同区域的差异，这是科学家们非常感兴趣的。有了MSI Segmentation这款MicroAPP，就可实现快速对化合物进行归类，查看切片空间的差异情况。
MSI Segmentation接受ASCII文本文件的输入，其中包含每行的(x,y)坐标和m/z强度，通过High Definition imaging(HDI)软件采集的MS成像数据可直接导入。
具体功能描述：
自动选择样品区域，排除背景，加速处理速度；
根据谱图相似程度在成像图上进行归类，直观看到切片空间的差异情况；
根据相似的成像或空间分布进行成分聚类，便于相关成分的快速分析；
可快速查看目标成分相关的其他成分信息（ formula/name 等）；
可选择目标像素质谱图，并以此为基准，根据谱图相关性生成空间分布图。
更多信息可阅读应用纪要：MSI Segmentation Solution
软件二：MSI Analyte Browser
快速批量查看成像图、匹配数据库并导出
像放电影一样快速批量查看质谱数据对应的成像图，对比其与总谱图差异，去除同位素干扰，并进行自动的数据库匹配，使可视化效果更佳。通过High Definition imaging(HDI)软件采集的MS成像数据可直接导入其中。
具体功能描述：
自动匹配HMDB数据库，结果可全部导出；
自动识别同位素并与其单同位素做归属，排除干扰；
可快速查看任意m/z的成像图；
任意像素点可快速查看其对应质谱图及与总谱图的差异谱图；
可快速查看top 50的成像图；
所有成像图可生成放映video，方便查看。
更多信息可阅读应用纪要：MSI Analyte Browser Solution
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