环境微生物核酸提取新时代！一键破解提取难题！

TIANGEN

2024.5.07

“近年来，随着生物技术的飞速发展，环境微生物的研究和应用取得了长足进步，如在废水处理、土壤修复、生物农药和生物肥料的生产方面都取得了显著成效[1]。同时，环境微生物在新药、酶制剂和生物材料的开发上发挥了重要作用，为可持续发展做出了重要贡献[2]。

核酸提取作为环境微生物学研究的基础，它直接决定了后续分子生物学分析的准确性和可靠性。但面对复杂多样的环境样本，如何高效、准确地提取微生物核酸仍是科研人面临的一大挑战。

环境微生物核酸提取难点解析

样本复杂性

环境样本中微生物种类繁多，不同微生物的核酸含量、结构等差异较大，使得提取过程难以统一。

细胞壁结构差异

不同微生物的细胞壁结构不同，如G+、G-和真菌在细胞壁成分和厚度方面具有明显差异，裂解不充分可能使核酸提取出现偏好性，因此要选择适当的裂解方法以有效释放核酸[3]。

抑制剂干扰

环境样本中常含有腐殖质、色素等杂质，如土壤中的腐殖质、水体中的盐分等，这些物质会干扰核酸提取纯化和后续的检测分析[4]。

操作繁琐

传统的核酸提取方法通常涉及多个步骤，操作繁琐，易引入污染，影响提取效果。

环境微生物

自动化核酸提取解决方案

TIANGEN凭借多年的核酸纯化经验，针对环境微生物核酸提取难题，整合了高通量研磨均质仪、全自动核酸提取纯化仪及其配套试剂，创新性地推出了一套高效且精确的核酸提取方案。该方案能轻松应对各类环境样本，高效提取微生物基因组DNA，显著提升提取效率和产量。提取出的核酸可直接用于PCR、建库、测序等分子生物学实验。

样本前处理

Sample Pre-processing

◆ 均一性好：三维∞字振动模式，研磨效果更均一。

◆ 得率高：提供最适研磨方案，研磨更充分，实验结果得率高。

◆ 通量高：1-24个样本同时研磨，通量大，效率高。

◆ 适用性广：可处理各种样本，包括土壤、粪便、水体、细菌、真菌等。

核酸提取纯化

Nucleic Acid Extraction & Purification

◆ 高效便捷：磁珠法全自动化提取1-8或16个样本，一键运行，省时省力。

◆ 稳定均一：自动化操作稳定性好，实验结果可重复性高，均一性好。

◆ 得率高：预分装研磨珠配合高效裂解液，可裂解多种复杂成分，保证微生物多样性及得率。

◆ 纯度高：独特的脱腐殖酸缓冲液可有效去除腐殖酸等抑制物，获得高纯度DNA。

◆ 通用性广：独特的样本破碎与裂解体系，适用于各种样本，覆盖多种微生物类群。

实验案例

Experimental Cases

可有效提取多种环境样本基因组DNA

使用TGuide S16核酸提取纯化仪搭配DP613和竞品（国际知名品牌 A、B）分别提取各类样本的基因组DNA，电泳结果显示，DP613提取效果较好。

16s区域可有效检出

将使用TGuide S16核酸提取纯化仪搭配DP613和竞品（国际知名品牌 A、B）提取小鼠粪便、竹林土+红茶粉样本得到的微生物基因组DNA，用细菌16s引物（V3-V4）进行PCR检测，电泳结果显示，DP613与竞品提取的核酸进行16s扩增均可有效检出。

ITS区域可有效检出

将使用TGuide S16核酸提取纯化仪搭配DP613和竞品（国际知名品牌 A、B）提取池塘淤泥、竹林土+红茶粉样本得到的微生物基因组DNA，扩增ITS区域（ITS1）进行PCR检测。电泳结果显示，DP613与竞品提取的核酸进行ITS扩增均可有效检出。

抑制物残留低，可进行后续实验

使用TGuide S16核酸提取纯化仪搭配DP613和竞品（国际知名品牌 A、B）提取的核酸原液作为PCR的抑制物，加入到qPCR体系中检测已知浓度的质粒，判断提取产物对PCR实验的抑制性。结果表明，DP613提取的核酸，PCR的抑制物与竞品A相当且明显优于竞品B，几乎不影响定量PCR反应。

适用于微生物群落分析

使用TGuide S16核酸提取纯化仪搭配DP613、竞品（国际知名品牌 A、B）提取微生物群落标准品（Zymo-D6300）基因组DNA，然后进行16s测序，分析各菌属水平检测的Tags比例。每个试剂盒进行两次平行实验。结论：DP613提取的微生物基因组DNA，8个细菌微生物均被检出，与标准品的混合比例类似。

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