赖氨酸琥珀酰化--善于抢“头条”的蛋白质修饰新贵(四)
书接上文
在上篇剖析了危及生命病原体结核杆菌中琥珀酰化的作用,立即引起了其他细菌生物家的兴趣,科学家们迅速着手在新的细菌中开拓琥珀酰化研究新战场,这不琥珀酰化又登上《PLoS One》的头条了~~~
在本研究中研究者运用了基于高通量质谱的SILAC定量蛋白质组学分析技术鉴定和定量枯草芽孢杆菌分别在葡萄糖和柠檬酸盐中应对碳源乙酰化水平和琥珀酰化水平的变化。实验得到了以下结果:
鉴定到629个乙酰化蛋白,1355个乙酰化位点;204个琥珀酰化蛋白,327个琥珀酰化位点;
通过生物信息学分析发现,枯草芽孢杆菌的乙酰化水平在两种生长条件下针对不同代谢通路:在葡萄糖中主要影响支链氨基酸生物合成和嘌呤代谢,在柠檬酸中主要影响柠檬酸循环;而在柠檬酸中琥珀酰化水平则优先影响柠檬酸循环;
乙酰化和琥珀酰化主要针对不同赖氨酸残基,并表现出不同的残基周边修饰位点,这种现象表明这两种修饰可能取决于不同的因素,例如酰基基团特性,赖氨酸基质的分子环境及修饰酶影响。
研究者观察到蛋白质乙酰化及琥珀酰化水平在中心碳代谢,及转录和翻译组件(如RNA聚合酶和核糖)发生显著变化,突变,调节蛋白质酰化对枯草芽孢杆菌生长有着显著影响;
乙酸激酶(ackA)突变增加了乙酰化的表达水平,表明乙酰磷酸盐依赖的乙酰化就像在大肠杆菌中一样,在枯草芽孢杆菌中是常见的;
研究表明,枯草芽孢杆菌的酰基修饰在生理适应碳养分变化中起到至关重要的作用。
研究者在文章的最后呼吁研究人员关注并投入到枯草芽孢杆菌乙酰化及琥珀酰化等酰化修饰的研究中来,为揭开翻译后修饰如何对菌类生长的生理作用产生影响而共同奋斗!
当然小编知道大家会问琥珀酰化与乙酰化之间crosstalk现象是不是很普遍?在别的物种里有没有类似的发现?
下一篇,小编会再总结一篇关于科学家如何通过研究琥珀酰化及乙酰化修饰,来揭开副溶血性弧菌生理及致病性的角色,敬请期待~~~
本篇参考文献:
KosonoS, et al. (2015) Changes in the Acetylome and Succinylome of Bacillussubtilis in Response to Carbon Source. PLoS One. 10(6): e0131169.
景杰生物(PTM BioLabs)凭借其强大的研发实力,提供独家开发的高灵敏度赖氨酸琥珀酰化抗体(PTM-401/PTM-402/PTM-419)及基于高等级质谱仪的高通量蛋白质组学技术服务,有效的推动蛋白组学研究进展。此外,景杰生物还提供全球最多种类的蛋白质修饰组学技术服务,包括赖氨酸乙酰化 (acetylation)、甲基化 (methylation)、泛素化 (ubiquitination)、磷酸化 (phosphorylation)、O-乙酰氨基葡萄糖化 (O-GlcNAc)、巴豆酰化 (crotonylation)、丙酰化(propionylation) 等。
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