【景杰生物】“4D-Blood+”高深度血液蛋白组，1000+覆盖深度创新升级

图1. 血液中蛋白质含量的数量级分布

为了应对高丰度蛋白的挑战，目前普遍使用的做法是使用试剂盒去除高丰度蛋白，但是由于高丰度蛋白含量极高，抗体试剂盒的去除不可能完全，其残留的蛋白仍然足以对蛋白组检测产生显著的影响。

而另一方面，人们也在通过调整质谱设置的方式进行优化，例如DDA进行HPLC预分级、DIA建立历史库等方式来尽量提高检测深度。但是即便如此，普遍的检测深度仍然多数徘徊在500-600的深度范围[1,2]，并且这些方式如果过度使用来一味追求更高检测深度，不但会大大增加成本，而且将对鉴定和定量的可靠性带来负面影响。

 图2. 左，使用FAIMS前后的血浆蛋白质鉴定数目；右，使用FAIMS的两次技术重复的平行性分析

基于FAIMS的血液蛋白组检测，相比于传统的方法有一系列的优势。

• 相比于传统TMT的方法，其不受制于标记通道数的限制，适用性更加广泛；

• 相比于传统的DDA方法，其不会造成大规模分级而推高的成本；

• 相比于传统的DIA方法，其在实现蛋白组深度覆盖的同时不会牺牲鉴定的可靠性。