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Molecular Cancer| 重庆医科大学陈俊霞团队揭示circACTN4促进乳腺癌发生发展的新机制

吉凯基因
2021.6.24

在大多数国家,乳腺癌已成为女性发病率第二高的癌症。在全球范围内,2018年新诊断乳腺癌约210万例,约占所有女性恶性肿瘤病例的25%,因此,迫切需要寻找新的治疗靶点和治疗策略。环状RNAs (circRNAs)是近年来应用高通量测序在很多物种中广泛发现的一类新的RNAs。circRNA在不同的病理情况下显示出疾病特异性和发育阶段特异性的特征,这表明circRNA可以作为新的潜在的生物标志物用于诊断和治疗。越来越多的证据表明,表达失控的circRNAs参与了乳腺癌的进展。

6月11日,重庆医科大学陈俊霞教授团队在国际著名肿瘤学期刊Molecular Cancer 杂志在线发表题为“The circACTN4 interacts with FUBP1 to promote tumorigenesis and progression of breast cancer by regulating the expression of proto-oncogene MYC”的文章,团队中研究生王晓松作为本篇文章第一作者。报道发现circACTN4在乳腺癌中高表达,并通过结合FUBP1调控myc的转录与表达,从而促进了乳腺癌的发生发展。

研究思路和方法

01

circACTN4的鉴定

作者通过微阵列分析筛选出高表达的环状RNA hsa_circ_0050900 (circACTN4),荧光原位杂交以及核质分离实验检测其主要定位于细胞核。相对于线性基因,circACTN4更加耐受放线菌素D和RNA酶 R消化。随后通过生物信息学预测、双荧光素酶报告基因和染色质免疫沉淀(ChIP)实验证明转录因子USF2与ACTN4的启动子区域结合,促进ACTN4转录。构建USF2的过表达和干扰质粒,证明USF2可以促进线性ACTN4以及circACTN4的表达。

图1.  circACTN4在乳腺癌中的验证和鉴定

02

circACTN4的表达

与临床病理分期的关系

qRT-PCR结果显示circACTN4在乳腺癌组织中显著高表达;ROC曲线显示circACTN4的表达可以作为乳腺癌的诊断指标;此外,circACTN4在乳腺癌细胞(MCF-7、SK-BR-3)中显著高表达;作者又利用乳腺癌组织芯片(TMAs)来测定ISH对circACTN4的表达,结果显示circACTN4高表达的患者总生存期更短。且circACTN4的表达与T期、N期、TNM期正相关。 

图2. circACTN4在BC中表达上调,

与BC患者病情进展及预后不良相关

03

circACTN4可促进BC细胞增殖,

调节BC细胞凋亡

作者构建circACTN4的过表达载体和小干扰质粒,通过qRT-PCR进行转染效率验证。随后通过平板克隆、EdU以及CCK-8等功能实验验证circACTN4可以促进乳腺癌细胞增殖。Hoechst 33342染色、流式细胞术以及western blot等实验验证敲低circACTN4可以促进乳腺癌细胞凋亡。

图3. circACTN4可促进BC细胞增殖,

抑制BC细胞凋亡  

04

circACTN4促进细胞的迁移和侵袭,

并调节细胞周期进程  

细胞划痕、小室侵袭和迁移等一系列实验结果显示circACTN4可以促进细胞的侵袭和迁移。随后作者用western blot检测转移相关蛋白nm23-H1、MMP9、MMP2蛋白水平,结果显示MMP9、MMP2蛋白水平与circACTN4表达呈正相关,而BC细胞中过表达circACTN4后,nm23-H1蛋白水平下调。 流式细胞术和western blot实验检测结果表明敲低circACTN4可以调节乳腺癌细胞周期的进程。

图4. circACTN4促进BC细胞的迁移、

侵袭和细胞周期进程

05

circACTN4与FUBP1相互作用,

激活MYC转录

为了探索circACTN4的分子机制,作者通过pull down联合质谱分析以及RIP实验验证circACTN4与FUBP1相互结合,且circACTN4和FUBP1在细胞核中共定位。 作者发现circACTN4的水平变化并没有改变FUBP1的表达水平,表明circACTN4没有参与FUBP1的翻译后调控。qRT-PCR、western blot和 Pearson相关分析结果证明FUBP1明显促进MYC在乳腺癌细胞表达水平且FUBP1在乳腺癌组织的表达明显高于邻近的正常组织,并且circACTN4的水平与BC组织中FUBP1的表达呈正相关,MYC在BC组织中高度表达且与FUBP1的表达呈正相关,circACTN4与 MYC在乳腺癌中的表达正相关,circACTN4可以促进MYC和其下游蛋白CDK4 ,CCND2的表达。

图5.circACTN4可以与FUBP1结合,

上调MYC的表达

06

circACTN4和FIR竞争结合FUBP1

为了验证circACTN4和FIR是竞争关系的假设,通过qRT-PCR检测结果表明FIR的表达在乳腺癌中明显下调。Pearson相关分析显示,在BC组织中FIR的表达与circACTN4、FUBP1、MYC水平呈负相关。 随后,作者通过Co-IP和一系列ChIP实验验证了circACTN4与FIR是竞争性结合FUBP1的。 此外,作者通过qRT-PCR和western blot结果发现,FIR的水平与MYC的水平相反。最后,作者通过共转染后的qRT-PCR结果发现,过表达FIR可以逆转circACTN4对MYC表达的增强作用,而敲低FIR可以抵消circACTN4下调对MYC表达的抑制作用。

图6. circACTN4阻断FUBP1与FIR的结合

07

FIR逆转circACTN4

在BC细胞中的促肿瘤作用

作者通过质粒共转染进行一系列的挽救实验,验证circACTN4是否通过circACTN4/FUBP1/MYC轴发挥生物学作用,结果表明,FIR过表达可显著逆转circACTN4上调对BC细胞增殖、迁移和侵袭的促进作用。 此外,IF实验也显示过表达和敲除FIR可以明显逆转circACTN4上调和下调对MYC表达的影响。western blot分析显示,FIR可以逆转circACTN4对MYC及其下游蛋白CDK4和CCND2表达的促进作用。  

图7. FIR逆转circACTN4在BC细胞中的致癌作用

08

circACTN4促进体内异种移植瘤

的发生和转移

进行一系列体内实验,结果显示过表达circACTN4组移植瘤的体积和重量明显大于对照组。 此外,与对照组相比,circACTN4上调明显增加了转移性肺结节的数量,且circACTN4可显著促进肿瘤血管生成。western blot结果显示,过表达或沉默circACTN4组移植瘤组织中MYC蛋白水平显著升高或降低。生物发光结果显示circACTN4过表达增强了乳腺癌细胞在裸鼠体内的增殖和转移。 此外过表达circACTN4组小鼠总生存率更低,肝转移更广泛。 最后,我们通过免疫组化的方法确定了circACTN4促进靶蛋白MYC、下游细胞周期相关蛋白CDK4和CCND2以及细胞增殖相关蛋白Ki67的表达。 

图8. circACTN4促进BC细胞在体内的发生和转移

研究总结

1. 作者在乳腺癌中发现一个新的基因circACTN4,并验证其在乳腺癌组织和细胞中显著高表达,且与临床病理分期分级、不良预后相关。

2. 通过一系列体内外实验,验证circACTN4可以促进乳腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭。

3. 作者发现circACTN4可以通过与FIR竞争性结合FUBP1,阻断FIR和FUBP1的结合,从而促进原癌基因MYC的转录和表达。

吉凯助力

该研究中使用的USF2、FUBP1以及FIR的过表达、干扰质粒载体以及荧光素酶标记的环状RNA的过表达和干扰慢病毒载体由吉凯基因提供,助力实现高效特异的基因过表达和敲低技术。

作者简介

重庆医科大学基础医学院分子医学与肿瘤研究中心陈俊霞教授为论文通讯作者。基础医学院王晓松硕士研究生为论文独立第一作者。

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