每年国家食品安全风险评估中心都会根据当年的实际情况制定《国家食品污染物和有害因素风险监测工作手册》（以下简称《手册》），各地疫病预防控制中心也承担了每年的风险评估任务，《手册》中包含了如：农药残留、兽药及违禁药物、生物毒素等诸多涉及液质联用标准操作方法。
SCIEX的QTRAP®质谱系统是将行业标准的三重四极杆质谱技术与线性离子阱复合型技术相结合。如MRM-IDA-EPI、Q3MS-IDA-EPI、Precursor Ion-IDA-EPI和Neutral loss-IDA-EPI等扫描模式，可以提供超快的扫描速度，以及高于传统三重四极杆质谱两个数量级以上的二级碎片全扫描灵敏度。目前，化合物筛查的整体思路主要分为目标物筛查（Target screening）和非目标物筛查（Non-target screening）以及半靶向目标化合物筛查等。解决方案流程展示如下。
一
目标物筛选（Target screening）
MRM-IDA-EPI复合型扫描模式，不但客户获得MRM数据，还可以获得高质量的EPI二级谱图（增强子离子扫描），通过谱库匹配或者对二级碎片进行结构解析，给出定性筛查结果。流程如图1-1：
图1-1、MRM-IDA-EPI 扫描模式
目标物筛选（Target screening）
数据处理流程展示
第一步，选择Quantitation and targeted identification，即定量和目标物筛选同时进行流程
第二步，化合物MRM参数自动填写
第三步，化合物保留时间自动获取，积分参数调节
第四步，Library谱库选择
第五步，Library谱库得分设置
图1-2、“五步法”流程示意图
二
非目标物筛查（non-target screening）
Q3MS-IDA-EPI 和 EMS-IDA-EPI复合型扫描模式，通过Q3MS或EMS全扫描发现完全未知的化合物，之后进一步获得EPI二级谱图，通过谱库匹配或者对二级碎片进行结构解析，给出定性筛查结果。流程如下图所示：
图2-1、Q3MS-IDA-EPI 和 EMS-IDA-EPI 扫描模式
非目标物筛查（non-target screening）
数据处理流程展示
第一步，选择Non-targeted screening，即非目标物筛选流程
第二步，Library谱库选择
第三步，Library谱库得分设置
第四步，非目标物筛选提取色谱峰参数设置
图2-2、“四步法”流程示意图
半靶向化合物筛查
针对于有一定特征结构或官能团的化合物，通过母离子扫描或中兴丢失扫描（Precursor Ion、Neutral loss）发现未知化合物，结合EPI扫描组成Precursor Ion-IDA-EPI和Neutral loss-IDA-EPI复合型扫描模式，可以获得化合物的高质量EPI二级谱图，通过谱库匹配或者对二级碎片进行结构解析，给出定性筛查结果。该方法常常被应用于杂质、代谢产物和降解产物以及新型结构衍生物等化合物的发现和结构分析，流程如下图3-1：
图3-1、Precursor Ion-IDA-EPI 和 Neutral loss-IDA-EPI 扫描模式
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