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【学术前沿】人体肠道细菌寡营养培养组条件的优化研究
在肠道微生物组研究中，可培养的肠道微生物资源发挥着重要作用。作者团队优化了肠道菌群的培养组条件，为从人体肠道微生物群分离更多的菌种提供了有效的方法。感谢黄自然团队的研究和微生物学报的分享。
标题：人体肠道细菌寡营养培养组条件的优化研究
作者：黄自然，韩妮，常宇骁，李蕙敏，丁磊，谭亚芳，毕玉晶，杨瑞馥，吴家红
摘要
【目的】
探讨寡营养对人体肠道细菌培养组的条件。
【方法】
通过稀释富集培养基、固体平板和增菌肉汤培养基成分获得寡营养培养基。对健康人粪便样本分别用原液(0)、5、10、20、30和40倍稀释的富集培养基(添加羊血和瘤胃液的血培养瓶)连续增菌，在不同时间点(第0、3、6、9、15、27、30天)吸取增菌液，用YCFA (yeast casitone fatty acid)固体培养平板分离菌落；用YCFA增菌肉汤增菌后再次挑取单菌落，利用基质辅助激光解吸/电离飞行时间(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF)质谱和16S rRNA基因测序鉴定菌株。
通过比较上述6种寡营养条件分离肠道菌群的效果，选取富集培养基原液、稀释10倍和30倍这3种条件下分离效果较好的富集条件，与同样稀释倍数条件的固体平板和增菌肉汤分别组合成9种培养基条件，进一步优化肠道菌群的培养组条件。
寡营养培养组学的培养流程图
【结果】
在6种寡营养富集培养基中，未稀释(原液)、10倍和30倍稀释的富集培养基分离细菌的种类比其他稀释倍数多，其中10倍稀释的富集培养基分离细菌种数最多；同时除去原液，仅在寡营养条件中分离细菌为24种。
在进一步优化固体培养基平板和增菌肉汤下，发现原液富集培养基-10倍稀释的固体平板和增菌肉汤培养基、10倍稀释的富集培养基-原液或10倍稀释的固体平板和增菌肉汤培养基这3个组合分离的细菌种数较多；除去原液，仅在寡营养条件中分离细菌为20种，其中10倍稀释的富集培养基-原液的固体平板和增菌肉汤培养基分离的菌种数最多。
寡营养条件优化后分菌结果
【结论】通过稀释富集培养基、固体平板和增菌肉汤培养基成分获得的寡营养培养条件，能够分离出约40%的常规培养条件分离不到的细菌，为从人体肠道微生物群分离更多的菌种提供了有效的方法。
长按下方二维码下载文献原文：
参考文献：
[1]黄自然,韩妮,常宇骁,李蕙敏,丁磊,谭亚芳,毕玉晶,杨瑞馥,吴家红. 人体肠道细菌寡营养培养组条件的优化研究. 微生物学报, 2023, 63(9): 3641-3652
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