De novo测序也叫从头测序，不需要任何基因序列信息即可对某个物种进行测序。用生物信息学的分析方法对测读序列进行拼接、组装，从而获得该物种的基因组序列图谱。随着新一代测序技术的飞速发展，大大降低了基因组测序的成本和时间，为研究新物种全基因组序列提供了一个崭新的研究平台。

沃森生物采用Illumina第二代高通量测序平台和PacBio第三代测序结合的方法，对未知物种的个体进行基因组测序，Illumina能产生海量的数据，可为动植物基因组组装提供高覆盖度的数据, PacBio第三代测序平台能产生非常长的读长，能跨越基因组中高重复、高杂合等复杂区域,从而能得到非常好的基因组组装结果。从基因组水平上对物种的生长、发育、进化、起源等重大问题进行研究，将加深我们对物种的认识，在发掘重要的功能基因、培育优良新品种，加速分子育种进程及相关物种的各种研究提供可靠的基础。

技术路线：

1、  基因组组装

2、  基因组注释

·             重复序列分析与注释；

·             基因预测；

·             基因功能注释；

·             ncRNA注释。

3、  动植物比较基因组学与进化分析

·             基因家族分析；

·              物种系统发育树构建；

·              基因组共线性分析；

·              全基因组复制分析。

4、  基因组数据库网站的建立

1、Kim S,et al.Genome sequence of the hot pepper provides insights into the evolution of pungency in Capsicum species. Nat Genet. 2014: 10.1038

2、Wang X,et al.The locust genome provides insight into swarm formation and long-distance flight. Nat Commun.2014;5:2957.

3、Venkatesh B,et al.Elephant shark genome provides unique insights into gnathostome evolution. Nature. 2014;505(7482)