靶向代谢组
Targeting metabonomics
靶向代谢组学(Targeted metabolomics)是对目标明确的代谢产物在样品中的绝对含量进行检测。相对于全代谢组分析,靶向代谢组具有特异性强,检测灵敏度高和定量准确等特点。一方面,靶向代谢组作为全代谢组的延伸,可为后续代谢分子标志物的深入研究和开发利用提供有力支持;另一方面,通过对某类代谢物准确定量分析也可以结合其它实验数据揭示相关的分子生物学作用机制。
靶向代谢组学
技术的优点
实验流程
送样要求
注:顶空进样的样本最少2g
检测物质
LM精准靶向代谢物类型:
1、氨基酸类-kit
2、神经递质/核苷-kit
3、有机酸-kit
4、胆汁酸-kit
5、植物激素-kit
6、生物碱-kit
7、黄酮类-kit
8、木质素-kit
9、TMAO-kit
10、短链脂肪酸-kit
仪器设备
AB Sciex Triple Quad™ 6500
Waters Xevo G2-XS QTof
靶向代谢组学( Targeted Metabolomics)是代谢组学研究的重要组成部分,也是全代谢组研究的延伸与拓展。相对于全代谢组分析而言,靶向代谢组分析具有特异性强,检测灵敏度高和定量准确等几个特点。 通过对血液、尿液或其他体液以及组织中某一类特定的代谢物(比如某条代谢途径中的代谢物)的富集与准确定量定性分析,一方面可以结合其它实验数据揭示相关的分子生物学作用机制,另一方面,也可以为后续代谢分子标志物的深入研究和开发利用提供有力支持。
实例分析
非酒精性脂肪肝疾病氨基酸浓度变化影响肥胖及胰岛素抵抗
基本信息
材料:人血浆 主要技术:GC-MS靶向代谢组
期刊:Hepatology 影响因子:13.246
文章摘要
氨基酸在非酒精脂肪肝(NAFLD)患者中增加,其中谷氨酸,丝氨酸和甘氨酸因为参与谷胱甘肽的合成,浓度发生改变,推测它们的浓度可能与NAFLD的严重程度有关。利用GC-MS对血清中的氨基酸进行分析,稳态模型评估胰岛素抵抗,谷氨酸 - 丝氨酸 - 甘氨酸(GSG)指数与肝脏病理之间的关系。实验发现,大多数氨基酸只在NAFLD-Ob患者中增加,只有丙氨酸,谷氨酸,异亮氨酸和缬氨酸在NAFLD-NO患者中增加。谷氨酸,酪氨酸和GSG指数均与肝胰岛抵抗相关。GSG指数可作为独立于肥胖指数的代谢标志物检测肝脏疾病的严重性。
方法流程
1、样本临床特征信息
2、血浆中氨基酸含量检测
3、GSG指数与氨基酸水平相关性
4、肝囊状程度与氨基酸分布
肝炎症程度与氨基酸分布
肝纤维化程度与氨基酸分布
小鹿推荐
文章是典型的靶向代谢质组研究案例。在研究分子标志物领域,靶向代谢组学技术有着非常好应用前景,因为稳定性,灵敏度和通量高等特点,可同时检测多种代谢产物水平。本文选择不同的实验样本,对照组,肥胖NAFDL组及非肥胖NAFDL组,通过分析不同样本血浆中氨基酸水平差异,结合临床特征数据,建立了GSG指数模型,相比单一的代谢标志物,可更准确的检测NAFLD患者肝脏疾病的严重程度且排除肥胖等干扰因素。
文献来源
Melania Gaggini. et al., Altered amino acid concentrations in NAFLD: impact of obesity and insulin resistance. 2018, Hepatology.