细菌小RNA(sRNA)是一类长度在50~300 nt的调控RNA, 与细菌生长、代谢、应激反应、致病性密切相关。细菌sRNA多通过与靶mRNA配对, 在转录后水平影响目标mRNA翻译或稳定性,影响细胞的多种生理功能。云序生物为客户提供一站式细菌小RNA测序服务,能够帮助客户识别新的细菌小RNA,解析细菌小RNA表达谱,预测细菌小RNA的靶基因,促进其功能和机制研究。
云序特色
适用的细菌种类全面:云序生物拥有市面上最全的去rRNA试剂盒,能够去除各类细菌样品中的rRNA,高效地检测小RNA分子
特异性富集小RNA:特异性富集50-300 nt的小RNA片段,sRNA有效数据比例高
链特异性检测:链特异性建库方案,可以准确检测反义sRNA
专业的生物信息学分析:强大的生物信息学团队,满足客户的各类深入数据分析需求
数据分析
基本分析高级分析1. 原始数据整理,过滤和质量评估CS-BSR-001. sRNA靶基因预测2. 序列匹配与数据统计CS-BSR-002. sRNA靶基因的GO与信号通路分析3. sRNA识别和注释CS-BSR-003. sRNA-靶基因相互作用网络4. sRNA表达量计算 5. 差异sRNA筛选 6. sRNA表达聚类分析
数据展示
上图:sRNA分类统计
云序生物技术服务列表
1. 测序服务
转录组表观遗传组基因组真核生物原核生物miRNA测序细菌sRNA测序(h)MeDIP测序目标序列靶向测序小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA)原核生物mRNA测序RRBS测序外显子组测序lncRNA测序宏转录组测序全基因组甲基化测序人类基因组重测序环状RNA测序原核生物转录组测序ChIP测序16S rDNA测序mRNA测序原核De novo转录组测序RNA pull down宏基因组测序降解组测序 RIP测序 转录组测序 RNA甲基化测序 De novo转录组测序
2. 生信服务 & PCR技术服务
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