指对经过分离纯化、纯度较高的目标蛋白质(目标蛋白质纯度>80%)进行ESI质谱鉴定,获得磷酸化位点、肽段以及蛋白信息。对蛋白样本进行酶解,微量富集磷酸化肽段(可选),LC-MS/MS检测,利用得到的质谱图与相应数据库搜索比较,从而得到相关结果。
图:MAPK通路磷酸化位点无偏与有偏差检测技术方法对比
磷酸化位点
N-糖基化位点
O-糖基化位点
磷酸化和O-糖基化竞争位点预测
磷酸化肽段和磷酸化蛋白质鉴定
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BioGenius具有蛋白质组数据丰富的分析处理经验。分析内容涉及:原始数据蛋白鉴定分析,蛋白修饰分析,蛋白质结构域分析,蛋白质相互作用分析,蛋白质结构建模分析,采用分子动力学模型预测蛋白-蛋白对接与蛋白-配体对接及其结合位点等。
蛋白质组是对蛋白质特别是其结构和功能的大规模研究。蛋白质组学比基因组学要复杂得多。基因组是相当稳定的实体,而蛋白质组通过与基因组的相互作用而不断发生着改变。一个生命体在其机体的不同部分以及生命周期的不同阶段,其蛋白表达可能存在巨大的差异。
常用的定量蛋白组学技术有:iTRAQ技术,LC-MS/MS技术等。