实验目的:
很多生物医药的研究都采用培养细胞来进行,这些细胞可能是从各大细胞库得来,也可能是受赠于其它研究人员。据估计,15-20%的时间里,实验中所使用的细胞已经不是原来的细胞系,或者与其它细胞系发生了交叉污染。为此,很多细胞库现在都要对提交来的细胞系进行STR分型检测,并对细胞系之间的交叉污染进行监测。
实验原理:
广泛存在于人类及哺乳动物的基因组中,具有高度多态性,它们一般由2-6个碱基构成一个核心序列,核心序列串联重复排列,由核心序列重复数目的变化产生长度多态性。对于一个特定的个体,染色体上某个特定位置的重复序列的重复次数是固定的,而对于不同的个体在同一位置处的重复次数可能不同,这就构成了人群中这些重复序列的多态性。由于人类基因组中这种重复序列非常多,通过对这种多态性的检测,就可以明确区分个体与个体的不同,确定父母子的亲缘关系。
基于毛细管电泳检测的STR分型检测使用的是多重PCR复合扩增系统,可以同时扩增19个STR位点加1个性别决定位点Amelogenin,每个被分析的人源细胞系都有其独特的DNA重复模式,因此通过与基础图谱进行比对,即可对每一批新细胞系的种类进行确认。
实验范围:
1.1人类细胞20个基因座检测:
所选用的基因座不仅包含ATCC和JCRB细胞库中的基因座,更添加4个高度多态性位点——D19S433、D6S1043、D12S391和D2S1338,可方便与权威数据库进行比对,具有极高的准确性。位点如下:
D5S818 | D7S820 | D13S317 | D16S539 | vWA |
TH01 | AMEL | TPOX | CSF1PO | D19S433 |
FGA | D18S51 | D21S11 | D8S1179 | Penta E |
D3S1358 | Penta D | D6S1043 | D12S391 | D2S1338 |
1.2 小鼠细胞检测
小鼠基因组中8个高度多态性位:D1Mit159.1、D2Mit395.1、D4Mit170.1、D7Mit40、D11Mit4、D15Mit16、D17Mit51.1和Jarid1。
1.3 人鼠细胞交叉污染检测
采用人鼠复合扩增体系检测人类细胞中的小鼠细胞污染,主要应用在干细胞研究领域。同时可以用于判断人鼠细胞混淆的情况。
实验收费
900元/株细胞
实验周期
5~7个工作日