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预测癌症患者总体生存率的新型铁死亡相关基因特征构建
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品牌
研载生物
产地
全国
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预测癌症患者总体生存率的新型铁死亡相关基因特征构建
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产地:全国; 品牌:研载生物
研载生物科技(上海)有限公司
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产品描述
r
背景介绍
肝细胞癌(
HCC
)是一种高度异质性的疾病,预后预测具有挑战性。索拉非尼可诱导铁死亡,一种铁依赖性的受调节细胞死亡形式。然而,铁死亡相关基因在
HCC
中的预后价值仍有待进一步阐明。在本研究中,作者从公共数据库下载了
HCC
患者的
mRNA
表达谱和相应的临床数据。使用
LASSO
-
Cox
回归模型在
TCGA
队列中构建多基因特征。来自
ICGC
队列的
HCC
患者用于验证。结果表明,在
TCGA
队列中,大多数铁死亡相关基因在
HCC
和相邻正常组织之间存在差异表达。在单变量
Cox
回归分析中,
26
个差异表达基因
(DEG)
与总生存期
(OS)
相关。构建了一个
10
个基因的特征
sig
nature
,将患者分为两个风险组。与低风险组患者相比,高风险组患者的
OS
显著降低。在多变量
Cox
回归分析中,风险评分是
OS
的独立预测因子。
ROC
曲线分析证实了该
sig
niture
的预测能力。
r
数据来源
基因表达谱(
T
CGA
数据库、
I
CGC
数据库)
r
分析流程
r
参考文献
Liang JY, Wang DS, Lin HC, Chen XX, Yang H, Zheng Y, Li YH. A Novel Ferroptosis-related Gene Signature for Overall Survival Prediction in Patients with Hepatocellular Carcinoma. Int J Biol Sci. 2020 Jul 6;16(13):2430-2441. doi: 10.7150/ijbs.45050. PMID: 32760210; PMCID: PMC7378635.
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