组蛋白（Histones）是由H1、H3、H2A、H2B和H4五种蛋白组成的蛋白质，存在于真核生物体细胞的染色质中，因富含碱性精氨酸和赖氨酸而呈碱性，可与酸性的双螺旋DNA结合成DNA-组蛋白复合物。在甲基化转移酶的催化下，组蛋白的精氨酸和赖氨酸N末端可以发生甲基化。组蛋白甲基化可以调控基因转录，调控结果取决于甲基化残基和甲基化程度。因此，研究组蛋白甲基化的方式和程度具有重要的生物学意义。

组蛋白甲基化检测主要检测组蛋白是否发生甲基化以及发生何种甲基化，目前检测方法主要有传统的染色质免疫共沉淀（ChIP）、Western免疫印迹（Western Blot）、蛋白芯片以及新发展的基于质谱的检测方法等。

染色质免疫共沉淀法是将获得的染色质用超声波切割成小片段，再与甲基化组蛋白的特异性抗体进行免疫沉淀，分离出免疫沉淀染色质中的DNA进行后续PCR分析，对该组蛋白甲基化修饰进行精确地基因定位。

Western免疫印迹法是将蛋白质样品进行聚丙烯凝胶电泳电泳（SDS-PAGE），再转移到含有特异性抗体的固相载体薄膜上，待检测的蛋白质样品与对应的抗体进行特异结合可以检测该蛋白样品是否发生甲基化或发生何种甲基化。

蛋白芯片技术是将目的蛋白质样品与以特异性抗体为探针的抗体芯片进行杂交，再通过特定仪器检测该蛋白样品是否发生甲基化。

液相色谱串联质谱法是将组织样品进行分离纯化以得到纯的组蛋白，再利用质谱进行后续分析，将质谱获得的数据信息进行处理分析，从而实现对组蛋白甲基化的高通量检测。

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