一、 上海伯豪转录组测序服务简介
目前,上海伯豪推出的转录组测序服务项目主要是应用Applied Biosystems SOLiD 5500xl / Applied Biosystems SOLiD4 System、Illumina HiSeq2000 / Illumina Genome Analyzer IIx、Roche GS FLX等第二代测序系统,帮助科研人员了解某一物种特定器官或组织在某一状态下RNA转录情况,从而开展基因表达水平研究、转录本结构研究、转录本结构变异研究、低丰度新转录本发现和非编码区域功能研究等工作。
具体应用领域:
基因表达水平研究:可以定量检测基因的表达水平(RPKM);
转录本结构研究:UTRs区域鉴定、Start codon鉴定、内含子边界鉴定、可变剪切研究;
转录本结构变异研究:融合基因鉴定、cSNP(编码序列单核苷酸多态性)研究;
非编码区域功能研究:鉴定Non-coding RNA, microRNA前体及成熟的microRNA预测;
低丰度转录本及新转录本的发现。
三、 测序数据整体质量分析展示