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我要纠错| Ion PGM™ 系统的性能规格 | ||||
| Ion 314™ 芯片v2 | Ion 316™ 芯片v2 | Ion 318™ 芯片v2 | ||
| 产量 | 200个碱基 | 30-50 Mb | 300-600 Mb | 600 Mb – 1 Gb |
| 400个碱基 | 60-100 Mb | 600 Mb – 1 Gb | 1.2-2 Gb | |
| 读取 | 40-55万个 | 200-300万个 | 400-550万个 | |
| 运行时间 | 200个碱基 | 2.3小时 | 3.0小时 | 4.4小时 |
| 400个碱基 | 3.7小时 | 4.9小时 | 7.3小时 | |
| 研究领域 | 癌症研究 | 干细胞研究 | 宏基因组学 | |
| 遗传病研究 | 农业 | 法医学 | ||
| 微生物学 | 表观基因组学 | 古老DNA基因组学 | ||
| 关键应用 | 定向DNA测序 | de novo微生物测序 | ChIP测序 | |
| 拷贝数分析 | 细菌分型 | 甲基化分析 | ||
| 定向RNA测序 | 病毒分型 | SNP验证 | ||
| 小RNA测序 | 宏基因组学 | 测序法基因分型 | ||
| 目标选择方案 | Ion AmpliSeq™技术 | Ion TargetSeq™ 技术 | ||
| 文库方案 | Ion AmpliSeq™ Library Kit | Ion Total RNA-Seq Kit v2 | 384个条形码，Torrent Suite™ | |
| Ion Xpress™ Plus Fragment | Ion Library Equalizer™ Kit | 软件所支持 | ||
| Library Kit | ||||
| 数据分析方案 | Torrent Suite™软件处理信号，检出碱基，比对序列，并开展基本变异检出，作为Ion PGM™测序仪的初步分析软件。 | |||
| 定向DNA测序、定向RNA测序、微生物de novo测序、微生物分型及其他应用的优化数据分析流程已开发，利用第三方软件方案和免费下载的插件。 | ||||
| Ion Reporter™软件开展可控的变异分析、注释和报告，而应用特异的流程支持单个、家系以及配对的肿瘤正常分析。 | ||||
| Ion Reporter™ Oncomine®流程再加上Ion AmpliSeq™ DNA panel，让癌症研究人员能够解决区分癌症司机突变和乘客突变的关键挑战。 | ||||
| Ion PGM™ 测序仪的规格 | |||
| 工作环境 | 温度：68–77°F (20–25°C) | 间隙： | |
| (仅限室内使用) | 湿度：40-60% 非冷凝 | 后面12 in (30.5 cm) | |
| 海拔：<6500 ft (2,000 m) | 左侧4 in (10 cm) | ||
| 右侧4 in (10 cm) | |||
| 从工作台前缘到测序仪面板4 in (10 cm) | |||
| 工作台前方通道36 in (90 cm)，方便操作员操作 | |||
| 从工作台前缘到锥形管8 in (20.3 cm) | |||
| 气体供应 | 连接：0.25一键连接配件 | 压力：35-45 psi | 成分：氩气(4.5级，纯度为99.995%或以上) |
| 其他连接 | 以太网：1 GigE | USB：2个USB 2.0 | |
| 电源 | 电压：100V (min) - 240 V (max) | 频率：50/60 Hz | |
| 电流：9A (max) | 功率：200-300 W | ||
| 尺寸 | 宽度：24 in/61 cm | 深度：20 in/51 cm | 高度：21 in/53 cm |
| 重量 | 运输箱：85 lb/39 kg | 独立：65 lb/30 kg | |
| PGM™ Torrent服务器的规格 | |||
| 产品配置 | 单个独立的塔式计算机设备，包含在Ion PGM™ 系统内。 | ||
| 包括Torrent Suite™ 软件及所有必要的软件组件，带来信号处理、碱基检出、读取比对和变异检出。 | |||
| 处理器 | 两个6核2.66 GHz CPU | ||
| 内存 | 48 GB RAM | ||
| GPU处理器 | 1x NVIDIA® Tesla® GPUs | ||
| 存储（约） | 16 TB | ||
| 操作系统 | Ubuntu® 10.04 | ||
| 尺寸 | 宽度：8.5 in/21.6 cm | 深度：22.3 in/56.6 cm | 高度：22.3 in/56.6 cm |
| 重量 | 100 lb/45 kg | ||
| 电源 | 电压：100V (min) - 240 V (max) | 频率：50/60 Hz | |
| 电流：6.7A (max) | 功率：1,100 W | ||
| 数据格式 | 行业标准的FASTQ、SFF、BAM和VCF格式输出 | ||
工作流程：
Ion PGM Sequencer Specifications Ion PGM 测序仪技术参数
| Chip 芯片 | Expected Sequencing Run Time 期待的测序时间 | Expected Output* 期待的通量 | Expected Reads 期待的测读量 | ||
| 200-base reads | 400-base reads | 200-base reads | 400-base reads | ||
2.3 hr | 3.7 hr | 30-50 Mb | 60-100 Mb | 400-550 thousand | |
3.0 hr | 4.9 hr | 300-600 Mb | 600 Mb-1 Gb | 2-3 million | |
4.4 hr | 7.3 hr | 600 Mb-1 Gb | 1.2-2 Gb | 4-5.5 million |
*Expected output with >99% aligned/measured accuracy. Output is dependent on read length and application.
| Specifications for the Ion PGM™ Sequencer | |
|---|---|
| Working environment [for indoor use only] 工作环境（室内） |
Temperature: 68–77°F (20–25°C) Humidity: 40–60% non-condensing Altitude:<6,500 ft (2,000 m) Clearances: 12 in (30.5 cm) in rear 4 in (10 cm) on left side 4 in (10 cm) on right side 4 in (10 cm) from front edge of bench to sequencer bezel 8 in (20 cm) from front edge of bench to the conical tubes 36 in (90 cm) aisle in front of bench for operator access |
| Gas supply 供气 |
Connection: 0.25 in push-to-connect fitting Pressure: 35–45 psi Composition: Nitrogen (grade 4.5, 99.995% or better) |
| Other connections 其它连接 |
Ethernet: 1GigE USB: 2x USB 2.0 |
| Power 供电 |
Voltage: 100 V (min) to 240 V (max) Current: 9 A (max) Frequency: 50/60 Hz Power draw: 200-300 W |
| Dimensions 尺寸 |
Width: 24 in (61 cm) Depth: 20 in (51 cm) Height: 21 in (53 cm) |
| Weight 重量 |
Crated for shipment: 85 lb (39 kg) Free-standing: 65 lb (30 kg) |
| Additional Equipment 附加设备 |
PGM™ Torrent Server Ion Chef™ System Ion OneTouch™ System |