Applied Biosystems QuantStudio 3D 数字 PCR 系统是一个简单、经济实惠的平台,采用密封芯片技术,为进行数字 PCR 提供了高效、可靠和稳定的方法。基于一站式芯片的工作流程让您可以加载芯片、密封并继续扩增。
QuantStudio 3D 系统扩展了传统实时 PCR 的界限,可以绝对定量,无需使用标准曲线。
QuantStudio 3D 数字系统提供:
与基于液滴的方法相比,样品加载控制更佳,未完成的反应更少,从而确保绝对定量的更高精度
QuantStudio 3D 数字 PCR 系统只需不到30秒即可读取每个芯片,从而利用简单、高效的工作流程来进行数字 PCR。
简单的工作流程;只需加载和密封即可进行 PCR 和分析,如下所示:
韩国的 Lab Genomics, Inc. 使用 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统来识别 FFPE 样品中突变的频率。
韩国天主教大学使用 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统检测前列腺癌和肺癌中的低频率突变。
QuantStudio 3D 数字 PCR 系统精度
利用 8个assay的TaqMan 基因表达Assay Panel扩增五个独立的重复。所有检测值均在相应平均值(绿线)的 ±10%(红线)范围内。(A) 低水平基因表达的结果(HPRT1、MYC 和 VEGFA)。(B) 高水平基因表达的结果(18S、B2M、GAPDH、GUSB 和 PPIA)。
QuantStudio 3D 数字 PCR 系统的准确度
经过评估,QuantStudio 3D 数字 PCR 系统绝对定量的准确度与两种正交定量方法一致。使用男性基因组 DNA,利用 QuantStudio 12K Flex OpenArray 数字 PCR 板 (OA) 上的 UV 分光光度计和数字 PCR 测定两种浓度的拷贝数/μL,并在 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统 (QS3D) 上测定5个技术重复两种浓度的拷贝数/μL,然后进行对比。两种样品的预期目标浓度为300个拷贝/μL 和1,500个拷贝/μL,均在预期值范围内,而 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统得出的检测结果与其他方法相比具有极高的精度。
在9份独立 DNA 样品(相当于0–8个拷贝)中,对17号染色体上的 CCL3L1 基因位点的拷贝数分析所显示的精度和准确度。
(A) 实验设计和所检测样品组的结果数据。每个数字 PCR 检测值均落在预期值的标准差范围内。值得注意的是,所有检测值变异系数 (CV) 均小于2.55%,充分表明可以达到很高的精度。
(B) A 中所显示相同数据的图形表现。由于达到很高的精度,数字 PCR 结果可以区分出含有7个拷贝和8个拷贝的样品。
通过数字 PCR 进行 KRAS 微量等位基因定量的示例在 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统上,利用针对数字 PCR 进行了优化的定制 TaqMan SNP 基因分型分析检测 KRAS G12V 突变。
每份样品的结果表示突变质粒在野生型基因组 DNA 中的比例。0.1%目标表示在野生型基因组 DNA 背景中的突变细胞系中的突变基因组 DNA。所有样品均使用配备相对定量模块的 QuantStudio 3D AnalysisSuite Cloud Software 进行分析。(A) 目标检出突变率为10%。突变检出率为10.384%,置信区间为8.235–13.076%。(B) 目标检出突变率为1%。突变检出率为1.393%,置信区间为0.772–2.507%。(C) 目标检出突变率为0.1%。突变检出率为0.142%,置信区间为0.064–0.310%。(D) 野生型对照样品。
创新点:
定量精确:每张固态芯片把样本到20,000个大小一致的纳升反应孔进行数字PCR反应,与油包水液滴方法相比,上样更精确。 灵敏度:可奖多个芯片的数据汇集在一起,构建更大的“虚拟芯片”,最高可至百万分之一。 闭管操作:避免交叉污染的可能性。 快速操作:芯片加样和读取的步骤均只需不到一分钟。
使用 QuantStudio™ 3D 数字 PCR 系统套装将数字 PCR 带入您的实验室。Applied Biosystems™ QuantStudio™ 3D 数字 PCR 系统是一款价格实惠的数字 PCR 平台,兼具高准确度、灵敏度和精密度,占用空间小且具有可扩展性,易于使用,因此适合任何经验水平的用户。数字 PCR 通过在不使用参考或标准曲线的情况下实现灵敏和精确的绝对靶标定量,使新的应用成为可能。研究人员现在可以超越 Ct 进行绝对定量研究,检测极其罕见的事件或测定样品中靶标的确切数量。这种使用简单且价格实惠的 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统将数字 PCR 带给所有研究人员。QuantStudio 3D 数字 PCR 系统利用高密度纳米流控芯片技术将一份样品分配到多达 20,000 个独立反应孔中。样品和扩增产物在整个简化的工作流程中保持完整,并产生易于解读的结果(靶标拷贝数/µL) - 所有这些都尽可能降低了定量特定目标核酸序列所需的专业知识水平。只需将反应混合物上样至芯片,在 ProFlex™ 2 x 平板模块热循环仪上进行扩增,然后在 QuantStudio 3D 数字 PCR 仪器上读取靶标浓度即可。
简单的工作流程
简化的工作流程及zei少的样本处理步骤可实现一站式处理。只需加载并读数即可。
绝对定量
20,000个反应孔,可生成高精度和高灵敏度的数据(拷贝/μL),且无需标准曲线。
密封系统
采用密封芯片和非暴露的样本转移步骤,污染物较少。
可任意运行实验
每块芯片都可以单独运行,没有单次运行zei低样本数量限制。
空间要求低
体积小 (7”X 5”X 9”),可放置在几乎所有实验台上,且需要时可随时移动。
兼容
使用您现有的TaqMan? Real-Time Assay即可开展数字PCR实验
QuantStudio 3D芯片数字PCR系统采用了高密度的纳升流控芯片技术,可用于稀有突变
检测、两个靶点间的低倍数差异分析或样本中精确的靶点计数。由于数字PCR具有更
高的精度、灵敏度和绝对性质,因此适用于下列应用领域:
用于传统实时荧光定量PCR实验的分子标准品定量
病原体检测和载量测定
稀有靶点检测,如肿瘤学研究中的体细胞突变检测
GMO检测和污染评估
参照品和标准品生成
拷贝数变异
主要优点
简单的工作流程
简化的工作流程及zei少的样本处理步骤可实现一站式处理。只需加载并读数即可。
绝对定量
20,000个反应孔,可生成高精度和高灵敏度的数据(拷贝/μL),且无需标准曲线。
密封系统
采用密封芯片和非暴露的样本转移步骤,污染物较少。
可任意运行实验
每块芯片都可以单独运行,没有单次运行zei低样本数量限制。
空间要求低
体积小 (7”X 5”X 9”),可放置在几乎所有实验台上,且需要时可随时移动。
兼容
使用您现有的TaqMan? Real-Time Assay即可开展数字PCR实验
Applied Biosystems QuantStudio 3D 数字 PCR 系统是一个简单、经济实惠的平台,采用密封芯片技术,为进行数字 PCR 提供了高效、可靠和稳定的方法。基于一站式芯片的工作流程让您可以加载芯片、密封并继续扩增。
QuantStudio 3D 系统扩展了传统实时 PCR 的界限,可以绝对定量,无需使用标准曲线。
QuantStudio 3D 数字系统提供:
与基于液滴的方法相比,样品加载控制更佳,未完成的反应更少,从而确保绝对定量的更高精度
QuantStudio 3D 数字 PCR 系统只需不到30秒即可读取每个芯片,从而利用简单、高效的工作流程来进行数字 PCR。
简单的工作流程;只需加载和密封即可进行 PCR 和分析,如下所示:
韩国的 Lab Genomics, Inc. 使用 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统来识别 FFPE 样品中突变的频率。
韩国天主教大学使用 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统检测前列腺癌和肺癌中的低频率突变。
QuantStudio 3D 数字 PCR 系统精度
利用 8个assay的TaqMan 基因表达Assay Panel扩增五个独立的重复。所有检测值均在相应平均值(绿线)的 ±10%(红线)范围内。(A) 低水平基因表达的结果(HPRT1、MYC 和 VEGFA)。(B) 高水平基因表达的结果(18S、B2M、GAPDH、GUSB 和 PPIA)。
QuantStudio 3D 数字 PCR 系统的准确度
经过评估,QuantStudio 3D 数字 PCR 系统绝对定量的准确度与两种正交定量方法一致。使用男性基因组 DNA,利用 QuantStudio 12K Flex OpenArray 数字 PCR 板 (OA) 上的 UV 分光光度计和数字 PCR 测定两种浓度的拷贝数/μL,并在 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统 (QS3D) 上测定5个技术重复两种浓度的拷贝数/μL,然后进行对比。两种样品的预期目标浓度为300个拷贝/μL 和1,500个拷贝/μL,均在预期值范围内,而 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统得出的检测结果与其他方法相比具有极高的精度。
在9份独立 DNA 样品(相当于0–8个拷贝)中,对17号染色体上的 CCL3L1 基因位点的拷贝数分析所显示的精度和准确度。
(A) 实验设计和所检测样品组的结果数据。每个数字 PCR 检测值均落在预期值的标准差范围内。值得注意的是,所有检测值变异系数 (CV) 均小于2.55%,充分表明可以达到很高的精度。
(B) A 中所显示相同数据的图形表现。由于达到很高的精度,数字 PCR 结果可以区分出含有7个拷贝和8个拷贝的样品。
通过数字 PCR 进行 KRAS 微量等位基因定量的示例在 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统上,利用针对数字 PCR 进行了优化的定制 TaqMan SNP 基因分型分析检测 KRAS G12V 突变。
每份样品的结果表示突变质粒在野生型基因组 DNA 中的比例。0.1%目标表示在野生型基因组 DNA 背景中的突变细胞系中的突变基因组 DNA。所有样品均使用配备相对定量模块的 QuantStudio 3D AnalysisSuite Cloud Software 进行分析。(A) 目标检出突变率为10%。突变检出率为10.384%,置信区间为8.235–13.076%。(B) 目标检出突变率为1%。突变检出率为1.393%,置信区间为0.772–2.507%。(C) 目标检出突变率为0.1%。突变检出率为0.142%,置信区间为0.064–0.310%。(D) 野生型对照样品。