Orbitrap Exploris平台FAIMS-DIA蛋白质组学快速定量分析

方案摘要

数据非依赖性采集（Data-Independent Acquisition，DIA）是当前蛋白质组学中应用范围较广的定量方式。DIA扫描模式中，超高分辨质谱将一级质谱的质荷比范围分为若干窗口，快速地对特定质量范围内所有母离子进行碎裂并采集碎片离子。相比于传统的DDA方法，DIA定量有更好的重现性及准确性，DIA也更加适用于大队列定量蛋白质组学研究[1]。作为应用于大队列的定量蛋白质组学研究策略，拥有一个更高效更稳定的解析平台尤为重要。Orbitrap Exploris系列质谱是赛默飞世尔科技公司从 2019 年推出的全新静电场轨道阱超高分辨质谱仪平台，采用全新的设计，让仪器具有更佳的性能和更高的稳定性，并且能够兼容FAIMS Pro接口，进一步提高检测灵敏度和抗污染能力。本文使用 Orbitrap Exploris 480质谱，对Hela细胞蛋白质组和血浆蛋白质组进行DIA及FAIMS-DIA定量分析，考察 Orbitrap Exploris 480的DIA定量能力。