皮肤微生物多样性整体研究方案
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皮肤微生物多样性整体研究方案

产品属性

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产品描述

皮肤微生物多样性分析

 

产品内容:

提供皮肤微生物多样性分析的整套方案:“实验规划->样本采集->肠道微生物序列测定->生信统计学分析->论文协助”

 

样品采集:

可为客户提供样品采集棉签和样品保存器皿

 

检测平台:

IlluminaIon PGMPacBio等高通量测序分析、PCR-DGGE、实时荧光定量PCR、克隆文库等多种微生物多样性分析平台。

 

送样要求:

不同的样本类型,送样要求不一样。

详情请咨询公司技术热线

 

联系方式

技术咨询热线 /企业QQ    

电话询价:/

或请登陆公司官方网站查阅: www.tinygene.com   

E-mailsupport@tinygene.com

 

期待您的来电!专业、专注,用心服务!

 

  样品采集及运送:

  新鲜样品:根据相关文献收集样品

  DNA样品:浓度大于10 ng/uL,总量大于500 ng的基因组DNA,DNA纯度较差或降解会影响后继的扩增实验。如果方便的话,可提供电子版DNA电泳检测照片及 OD260/280的比值。

  样品运送:送样时采用干冰保存运输;若是距离较远,建议采用干冰加冰袋,存放于冰盒中。

 

HTS
高通测序分析流程

 

案例分析

标题:人体皮肤微生物的多样性概况

skin microbiome 01

研究领域:皮肤微生物

分析物种:细菌

取样方法:取皮肤表皮及皮下组织

skin microbiome 02

  高通量测序平台:Illumina MiSeq 2×150

  测序区域:16S rRNA gene V4区

主要结果:
(1)无皮肤病史的五个样本左、右手的113个OUT的系统发育树结构丰度
skin microbiome 03
(2)OUT单板描述
skin microbiome 04
(3).该图展示了样品根据它们Θ指数用UPGMA得到的发育树
skin microbiome 05
(4).相对丰度比较
skin microbiome 06
原文链接:http://genome.cshlp.org/content/18/7/1043.short

参考文献:
Grice, E. A., H. H. Kong, G. Renaud, A. C. Young, G. G. Bouffard, R. W. Blakesley, T. G. Wolfsberg, M. L. Turner and J. A. Segre (2008). “A diversity profile of the human skin microbiota.” Genome Research 18(7): 1043-1050.

微基生物科技(上海)有限公司

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