RIP（RNA Immunoprecipitation）是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术，是了解转录后调控网络的有力工具。这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来，然后经过分离纯化对结合在复合物上的RNA进行分析。RIP-Seq结合RIP技术和高通量测序，能够高通量地检测与特定蛋白结合的RNA，从而解析全转录组范围内的目标蛋白-RNA相互作用网络。详见：云序生物 RIP测序

 

云序特色

ü  全转录组覆盖：可分析与特定蛋白结合的所有转录本，包括mRNA和非编码RNA

ü  商业化的RIP试剂盒：云序生物采用商业化RIP试剂盒，保证了RIP实验的成功率和稳定性

ü  严格的质控：严格设置质控点，全程***实验质量，确保客户得到优质数据

ü  专业的生物信息分析：强大的生物信息学团队，满足客户的各类深入数据分析需求

 

数据分析

基本分析

高级分析

1.  数据过滤和接头序列去除

CS-RIP-001.  样品间差异结合峰的识别

2.  序列匹配与数据统计

CS-RIP-002.  差异峰相关基因的GO与信号通路分析

3.  图形化展示测序reads的基因组分布

CS-RIP-003.  结合峰的motif预测鉴定

4.  结合峰识别（peak calling）

 

5.  结合峰注释（peak annotation）

 

6.  结合峰相关基因的GO和信号通路分析

 

 

数据展示

 

云序服务内容

1. 测序服务

转录组

表观遗传组

基因组

真核生物

原核生物

miRNA测序

细菌sRNA测序

MeDIP测序

目标序列靶向测序

小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA)

原核生物mRNA测序

RRBS测序

外显子组测序

lncRNA测序

宏转录组测序

全基因组甲基化测序

人类基因组重测序

环状RNA测序

原核生物转录组测序

ChIP测序

16S rDNA测序

mRNA测序

原核De novo转录组测序

 

宏基因组测序

RIP测序

 

 

 

降解组测序

 

 

 

转录组测序

 

 

 

De novo转录组测序

 

 

 

 

2. 生信服务 & PCR技术服务

 

生信服务

实时定量PCR服务

转录组

表观遗传组

基因组

联合分析

环状RNA分析

DNA甲基化分析

基因组分析

circRNA-miRNA

功能分型PCR芯片