Small RNA是一类长度为18-30 nt，具有调控功能的非编码小RNA的总称。常见的small RNA主要包括：microRNA、siRNA和piRNA等。Small RNA广泛参与包括细胞生长、分化、凋亡在内的几乎所有生理过程，并与包括癌症在内的各种人类疾病相关。

    云序生物Small RNA组测序服务可以在一次实验中同时检测所有small RNA，为研究small RNA的功能和调控机制，或者筛选新的small RNA提供了强有力的工具。此外，云序生物还提供仅针对miRNA的测序服务，有效富集miRNA，在相同成本下提高了miRNA有效数据量和测序深度。

详见：云序生物 小RNA测序服务

 

技术优势

ü  全物种覆盖：无需预知序列信息，可对任意物种的small RNA组进行检测

ü  同时检测miRNA、piRNA和siRNA：在一次实验中同时检测miRNA、piRNA、siRNA和其它small RNA

ü  实时更新的small RNA数据库信息：可随时利用zei新的small RNA数据库对数据进行再分析，数据永久有效

ü  灵敏度高：可检测在单个细胞中仅一个拷贝的低丰度small RNA

ü  精确度高：可准确区分单碱基差异的small RNA

 

数据分析

基本分析

高级分析

1.  数据过滤和接头序列去除

CS-MIR-001.  miRNA靶基因预测

2.  序列匹配与数据统计

CS-MIR-002.  miRNA靶基因的GO与信号通路分析

3.  已知小RNA（miRNA/siRNA/piRNA）识别，注释和统计

CS-MIR-003.  miRNA-靶基因GO网络分析

4.  小RNA表达量计算

CS-MIR-004.  miRNA-靶基因信号通路网络分析

5.  差异小RNA筛选

CS-MIR-005.  miRNA上游转录因子分析

6.  小RNA表达聚类分析

CS-MIR-006.  新miRNA预测

 

CS-MIR-007.  miRNA分子标志物筛选

 

数据展示

 

云序服务内容

1. 测序服务

转录组

表观遗传组

基因组

真核生物

原核生物

miRNA测序

细菌sRNA测序

MeDIP测序

目标序列靶向测序

小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA)

原核生物mRNA测序

RRBS测序

外显子组测序

lncRNA测序

宏转录组测序

全基因组甲基化测序

人类基因组重测序

环状RNA测序

原核生物转录组测序

ChIP测序

16S rDNA测序

mRNA测序

原核De novo转录组测序

 

宏基因组测序

RIP测序

 

 

 

降解组测序

 

 

 

转录组测序

 

 

 

De novo转录组测序