DNA甲基化测序服务(MeDIP-Seq)
DNA甲基化对生命活动非常重要,是基因调控的手段之一(即,通过对位于启动子及第一外显子区的CpG岛的甲基化而抑制基因的表达),它在维持细胞正常功能、传递基因组印记,胚胎发育、肿瘤发生等方面起着至关重要的作用,更是表观遗传学研究的热点。
对于DNA甲基化的检测,言行生物推出了基于抗体富集原理的MeDIP Sequencing(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing),即:采用甲基化DNA免疫共沉淀技术,通过5-甲基胞嘧***抗体特异性富集基因组上发生甲基化的DNA片段,然后进行高通量测序(Illumina Hiseq 2500)可以在全基因组水平上进行高精度的甲基化位点检测,启动子甲基化对基因表达的调控, CpG岛结合启动子区域甲基化分析,甲基化图谱比对等分析。该技术不受物种和基因组区域的限制,是全面且深入理解表观遗传调控zei好的研究手段。
1、基本数据分析
数据产出统计:对测序结果进行图像识别(Base calling),去除污染及接头序列;统计结果包括:测定的序列(Reads)长度、Reads数量、数据产量。
2、高级数据分析
标准高级数据分析内容包括:
(1)MBD-Seq序列与参考序列比对;
(2)MBD-Seq序列比对的甲基化信息概况;
(3)统计每个甲基化区域的CG含量比率;
(4)分析甲基化区域在基因组的分布情况;
(5)分析甲基化区域与特定区域(Promoter,UTR,Exon,Intron)的位置关系;
(6)对不同样品的甲基化区域进行差异分析。
公司介绍
武汉言行生物科技有限公司提供各种蛋白质组学服务、代谢组学服务、高通量测序服务、生物芯片服务、荧光定量PCR服务、基因组编辑和整体课题外包等技术服务,成立于2008年。言行生物客户已发表《The Plant Journal》、《Proteomics》、《ES&T》、《PLoS ONE》、《BMC Genomics》等杂志。
公司以“言必信 行必果”为理念,竭力把更优的生物技术服务奉献给您!
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