微卫星(STR/SSR)分型检测服务
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微卫星(STR/SSR)分型检测服务

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产品描述

STR介绍

    STR(短串联重复序列),又称为微卫星标记或SSR。一般有2-6bp的核心序列串联重复而成,构成了STR基因座的遗传多态性。

STR/SSR具有分布广泛均匀、多态性丰富、遵循孟德尔共显性遗传、信息量大、检测简便等优点,STR/SSR分型高效快捷,结果准确,是非常重要的遗传标记,在遗传制图、连锁性分析、亲子鉴定、疾病基因定位和物种多态性研究等领域有着广泛的应用。

上海翼和生物微卫星分型服务:

根据具体实验规模,提供两种检测平台,分别为:适合中低通量检测的多重荧光PCR STR/SSR分型服务和适合高通量的基于二代测序的Hi-STR分型服务。

多重荧光PCR的微卫星(STR/SSR)分型服务

上海翼和生物采用通用荧光引物方案,多重PCR扩增STR/SSR位点,利用ABI遗传分析仪对荧光标记DNA片段进行检测,利用分子量内标进行DNA片段长度计算,使得微卫星分型变得高效,快捷,结果更加精确可靠。

技术路线:

 

技术特点:

 

服务流程

A.微卫星(STR/SSR)分型引物筛选

   1)客户提供样本以及位点信息;

   2)翼和设计相关位点的扩增引物,并合成;

   3)预实验抽样小试,摸索并优化反应条件(包括退火温度,镁离子浓度等);

   4)3730 XL测序仪电泳

   5)Genemapper分析,数据导出;

B.大规模分型实验

   1)大规模样本位点扩增;

   2)3730 XL测序仪电泳;

   3)Genemapper分析,数据导出;

   4)交付实验报告,包括实验材料,方法,引物序列等;

 

Hi-STR分型服务

Hi-STR结合多重PCR技术和高通量测序技术,对需要检测的位点设计特异性引物,在单管内进行多重PCR扩增,不同的样本以不同的Barcode引物区分。混合样本后,在Ion Proton/illumina Hiseq/illumina X10平台上,对扩增子进行高通量测序。测序结果使用生物信息学方法,实现对STR位点的检测,与传统的凝胶电泳或毛细管电泳相比,可以直接根据序列,准确判断STR位点的重复次数。Hi-STR适用于核心重复区域3bp的微卫星位点,配合各类高通量测序仪,使得STR分型具有更准确、更灵敏的特点,二代高通量测序,可将上千样本和STR位点混合检测,使检测更加高效经济。

技术路线:

 

技术特点:

 

本方法适用于动物植物及人类的遗传图谱绘制、QTL定位、生物多样性、动植物SSR位点检测、群体遗传结构等诸多领域。

 

相关链接:

多重荧光PCR的微卫星(STR/SSR)分型服务:http://www.biowing.com.cn/news/1/7.html

Hi-STR(高通量STR)分型服务:http://www.biowing.com.cn/news/1/112.html

 

上海翼和应用生物技术有限公司
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