简介:
全基因组甲基化测序 Bisulfite(全基因组甲基化测序):利用Bisulfite(亚硫酸盐)对基因组进行处理后上机测序。应用领域:测序可精确到单个碱基的甲基化,能得到全基因组的甲基化位点信息,可用于全基因组DNA甲基化图谱制作;疾病关联分析;基因调控分析;疾病的甲基化标志物等。
应用领域
全基因组DNA甲基化图谱构建
基因调控分析
分析内容
1. 标准信息分析
a)对测序数据进行base calling、raw data 数据整理及数据质量评估;
b)去接头污染,去低质量reads和产量情况统计
c)Bisulfite 测序序列与参考基因组序列的比对
d)深度和覆盖度分析
e)C 碱基的甲基化水平
f)全基因组甲基化水平分布趋势
g)全基因组DNA甲基化图谱
h)差异性甲基化区域(DMR)分析
2. 高级信息分析 根据具体研究进行的细节分析
样品要求
样品类型:DNA 样品; 样品需求量:总量≥5μg,浓度≥50ng/μL; 样品完整性:DNA 无明显降解,需提供凝胶电泳检测胶图。
项目周期
单个样品标准流程(上图)的运转周期约为45个工作日。遇样品数较多时,项目周期根据项目规模而定。