简介

MeDIP-seq：利用MeDIP技术富集甲基化的DNA片段，再利用大规模测序技术测序。研究者可以较小的数据量，快速高通量地发现靶基因组上的甲基化区域。应用领域：DNA甲基化研究; 比较不同细胞、组织、疾病样本间的DNA甲基化修饰模式的差异；DMRs（甲基化差异区域）的研究。

应用领域

样本间DNA甲基化修饰差异分析

大样本量疾病研究

比较不同细胞、组织、疾病样本间的DNA甲基化修饰模式的差异；

DMRs（甲基化差异区域）的研究。

分析内容

1. 标准信息分析

对测序结果进行base calling、raw data 数据整理及数据质量评估

2. 高级信息分析

    a)MeDIP-seq序列与参考序列的对比

    b)MeDIP-seq序列数据在全基因的分布趋势

    c)统计MeDIP-seq序列富集区域（peak）的信息

    d)基于Peak的多样品间差异分析

    e)可结合客户的需求，协商确定个性化信息分析内容 样品要求 样品需求量：总量≥5μg，浓度≥50ng/μL； 样品完整性：DNA无明显降解，需提供凝胶电泳检测胶图

项目周期

完成时间：单个样品标准流程（上图）的运转周期约为50个工作日。遇样品数较多时，项目周期根据项目规模而定。 完成标准：产生不少于合同的clean data