GRSAM-13：自然选择分析: 多样性与分歧进化

自然选择可以通过以下方式影响基因周围区域DNA变异的水平：（1）非常具有危害性的突变会被自然选择快速地消除；（2）具有微弱有害的突变可能分散于群体中，但是很少被固定存留下来；本分析模块可以探索基因周围区域的杂合度多样性模式，分析基因结构序列上不游区域的多样性（Diversity，包括Watterson’s θ，Tajima’s π）与分歧（divergence）；根据基因型计算基因结构序列上的多样性程度，即杂合度(heterozygosity)；也可分析编码转录本的起始/终止位置临近区域的多样性和进化分歧度；  

 

全基因组重测序 

 

全基因组重测序是zei全面完整获取待研究物种样本基因组结构信息的研究策略。它可以获取全部基因组变异体结构，包括点突变SNP/短插入缺失（indel），基因组重排导致的结构变异（SNV），拷贝数变异（CNV）, 杂合性缺失（LOH），重复区段（SD），以及重组热点区域（Recombination Hot spots）等基因组特征和规律。基于精确稳定的Hiseq2500高通量测序平台，凭借多年稳定信息学研究分析经验，惠研生物（BioGenius）可利用基因组测序数据进行重排突变和基因组结构功能分析; 全基因组关联分析与数量性状（QTL）分析；并可整合多方面基因组学数据做关联分析，包括转录组学数据，表观组数据等，可配合比较基因组学，群体遗传学分析技术，进化分析和计算生物学分析方法深入探索感兴趣的科学问题。

全基因组适用于：

• 基于家系遗传病研究；
• 复杂疾病研究；
• 基因组进化，
• 种群体遗传学与性状连锁等研究。
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