GRSAM-14：自然选择分析: 选择清除作用

选择相关清除作用（selective sweep）是指由于某一位点或座位（locus）受到强选择后，其周围位点因受该位点牵连而发生基因多态性（gene polymorphism）或杂合性（heterozygosity）降低的现象。某个位点发生突变，突变后的位点因对物种在特定的情况下有利或者受到了人为的选择（selection），那么该突变位点在群体中的出现频率必然提高，但是其附近和它处在同一个单倍型/单元型（haplotype）或者同一区域（block）的其他多态位点同样跟着受到了选择，频率也发生了提高，也就是该单倍型或区域内的其他多态位点的某一多态形式比率（rate）大大提高，经过若干代后，群体中没有被选择保留的位点被逐步清除掉，而整个相关区域的多态性降低了。

（1）全基因组重测序杂合率分布统计  （2）选择清除作用（selective sweep）分析 

 

全基因组重测序

全基因组重测序是zei全面完整获取待研究物种样本基因组结构信息的研究策略。它可以获取全部基因组变异体结构，包括点突变SNP/短插入缺失（indel），基因组重排导致的结构变异（SNV），拷贝数变异（CNV）, 杂合性缺失（LOH），重复区段（SD），以及重组热点区域（Recombination Hot spots）等基因组特征和规律。基于精确稳定的Hiseq2500高通量测序平台，凭借多年稳定信息学研究分析经验，惠研生物（BioGenius）可利用基因组测序数据进行重排突变和基因组结构功能分析; 全基因组关联分析与数量性状（QTL）分析；并可整合多方面基因组学数据做关联分析，包括转录组学数据，表观组数据等，可配合比较基因组学，群体遗传学分析技术，进化分析和计算生物学分析方法深入探索感兴趣的科学问题。

全基因组适用于：

• 基于家系遗传病研究；
• 复杂疾病研究；
• 基因组进化，
• 种群体遗传学与性状连锁等研究。

更多详情：http://www.biogenius.cn/htm/products/genomics/wgs/analysis/258.html

 

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