GRSAM-08：病原体-宿主基因组整合分析

本模块将针对特定病原体与宿主基因组整合事件进行深度分析，例如HBV病毒整合嵌合于宿主基因组。本方案将针对病原体（病毒）整合位点的功能与上下游基因表达情况，以及表观标记的动态性改变，或者基因组结构的重组率，DNA复制速率以及其他染色体结构不稳定性指标进行数据整合分析，探讨病毒宿主整合基因组对宿主基因组，转录组，表观组甚至免疫组的改变、扰动。 

 

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全基因组重测序

全基因组重测序是zei全面完整获取待研究物种样本基因组结构信息的研究策略。它可以获取全部基因组变异体结构，包括点突变SNP/短插入缺失（indel），基因组重排导致的结构变异（SNV），拷贝数变异（CNV）, 杂合性缺失（LOH），重复区段（SD），以及重组热点区域（Recombination Hot spots）等基因组特征和规律。基于精确稳定的Hiseq2500高通量测序平台，凭借多年稳定信息学研究分析经验，惠研生物（BioGenius）可利用基因组测序数据进行重排突变和基因组结构功能分析; 全基因组关联分析与数量性状（QTL）分析；并可整合多方面基因组学数据做关联分析，包括转录组学数据，表观组数据等，可配合比较基因组学，群体遗传学分析技术，进化分析和计算生物学分析方法深入探索感兴趣的科学问题。

全基因组适用于：

• 基于家系遗传病研究；
• 复杂疾病研究；
• 基因组进化，
• 种群体遗传学与性状连锁等研究。

更多详情： http://www.biogenius.cn/htm/products/genomics/wgs/analysis/253.html 
 

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