产品描述
本模块分析目的是针对模式动物的miRNA不同区域的SNP位点和MAF进行统计分析。针对疾病模型下的miRNA突变分析，分析研究可能的SNP在miRNA本身及其靶基因结合区域上的分布和影响。我们将对miRNA的pri-mRNA，pre-miRNA以及miRNA靶基因序列进行分析，识别潜在的SNP功能位点。据文献研究提供证据表明Humanpre-miRNA的二级结构中存在不同位置上的SNP，我们将通过热力学稳定性分析方法评估SNP对pre-miRNA结构的影响；另外，我们也将对miRNA-Target靶基因相互作用位点做分析，评估对SNP对靶基因靶向性的影响。
（1)SNV，SNP与pri-miRNA关联分析;(2) SNV，SNP与pre-miRNA关联分析SNV，SNP与miRNA靶基因关联分析;(3) GWAS与miRNA关联分析：计算miRNA靶基因结合区域和侧翼序列上SNP的分布密度；(4) GWAS与miRNA关联分析-根据GWAS的易感位点的分布和关联分析研究miRNA基因，pre-miRNA，及其miRNA靶基因是否存在易感loci。
图例：pri-miRNA与miRNA seed区发生的基因多态性改变实例
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MicroRNA(miRNA)是具有调控基因表达功能的非编码RNA，通常长度为~22nt，在基因表达的转录后调控水平发挥重要功能。成熟的miRNA是从较长的具有局部颈环解结构(stemloop-hairpin)的RNA序列加工而成。miRNA的生物产生机制途径zei先发生与细胞核中的RNaseIII酶Drosha对pri-miRNA的颈环处碱基进行剪切，并生成~70-90bp的pre-miRNA发卡结构。pre-miRNA被转运至细胞质中，进一步由Dicer（RNaseIIIendonuclease）加工。Dicer识别双链RNA靠近颈环处的碱基并分离双链，产生两条单链，而其中一条链成为miRNA而互不的那条链则被降解。成熟miRNA序列一旦被释放生成，它将与mRNA的3’UTR的局部序列互补配对，并通过降解mRNA和抑制mRNA翻译而达到调控基因表达的目的。
miRNA是一类重要的基因表达调控因子，通常主要参与靶基因翻译的抑制过程，同时zei近研究也表明miRNA在哺乳动物细胞系统中的主要功能是降低靶基因mRNA的水平。每种保守的哺乳动物的miRNA都调控着数百个不同的靶基因，显示出调控系统的复杂性和系统性。因此，miRNA现在被认为是与转录因子同样重要的调控细胞蛋白质成分的重要分子。同样的，miRNA基因也受到精确的转录调节，并与后续的靶基因作用形成跟完整和系统的分子作用网络。
