RSAM-23 转录组进化分析:miRNA 进化分析

本方案针对转录组转录本预测miRNA发卡结构序列，并预测成熟miRNA.依据物种miRNA数据库分析待测物种之间的miRNA的系统发生树，分析miRNA家族的进化距离。采用多重比对的可视化与系统发生树形式展示miRNA家族的进化关系，在系统发生树中可以细节展示出每个miRNA家族是否出现（左图系统发生树内部枝干所指向的矩阵方阵所示，其中颜色梯度可以表示表达量程度）。 另外，本方案可对miRNA的靶基因进行预测，并对miRNA靶基因的序列进行进化分析。

（1）miRNA家族分析
（2） miRNA系统发生树构建
（3） miRNA靶基因进化分析
 

图例  miRNA家族分析 

 

  图例 miRNA系统发生树构建 


 

更多详情：http://www.biogenius.cn/htm/products/transcriptome/rnaseq/analysis/324.html

 

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