DCAM-10 ：DNA 甲基化差异位点邻近启动子区调控基序（motif ）的识别

 
本方案可以识别出差异甲基化区域上存在的特殊DNA序列模式，DNA基序(motif)。这些序列特征可能与差异化甲基化的发生机制相关，也可能在表观水平改变后对转录调控起到调控作用。 系统全面地识别发现顺式转录调控元件(cis-regulatory element)是重构差异化甲基化基因的启动子区调控元件的重要途径。我们在该项目中将系统识别差异甲基化基因中潜在受到转录因子调控的结合位点区域。
 
首先，根据差异甲基化基因启动子序列中的序列模式特征进行提取和训练，获得完全基于序列预测的结合位点-Motif；然后，将预测的Motif与目前已知的转录因子结合位点数据（包括JASPAR版本和zei新的TRANSFACT）进行PWM位置得分矩阵比对，从而获得潜在调控差异甲基化基因的转录因子。

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