GRSAM-22 同源IBD分析
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GRSAM-22 同源IBD分析

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GRSAM-22:同源IBD分析

 

本分析模块可通过全基因组测序识别IBD区域。IBD,即同源等位基因,分析对于复杂性状和疾病表型研究来说是通常需要考虑的内容。IBD用来衡量亲缘关系的远近,同时指明来自祖先的同源等位基因的状况。IBD分析通常应用于外显子组测序应用研究中,对于筛查同源等为基因突变提供重要的线索。

  

 

图-1 IBD(同源)与IBS(同型)的概念模式图  

 

  • C1-C5个体的多态性位点的IBD根据B1-B4个体来判断;
  • C1-C3中的G是IBD,均来自B1,而C4,C5的T是IBS而不是IBD;
  • C3不具有IBD,因为经过重组。

 

全基因组重测序

全基因组重测序是zei全面完整获取待研究物种样本基因组结构信息的研究策略。它可以获取全部基因组变异体结构,包括点突变SNP/短插入缺失(indel),基因组重排导致的结构变异(SNV),拷贝数变异(CNV), 杂合性缺失(LOH),重复区段(SD),以及重组热点区域(Recombination Hot spots)等基因组特征和规律。基于精确稳定的Hiseq2500高通量测序平台,凭借多年稳定信息学研究分析经验,惠研生物(BioGenius)可利用基因组测序数据进行重排突变和基因组结构功能分析; 全基因组关联分析与数量性状(QTL)分析;并可整合多方面基因组学数据做关联分析,包括转录组学数据,表观组数据等,可配合比较基因组学,群体遗传学分析技术,进化分析和计算生物学分析方法深入探索感兴趣的科学问题。

全基因组适用于:

  • 基于家系遗传病研究;
  • 复杂疾病研究;
  • 基因组进化,
  • 种群体遗传学与性状连锁等研究。

 

 


 

详情请点击:http://www.biogenius.cn/htm/products/genomics/wgs/analysis/266.html 


 


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  • 全基因组测序/外显子组, 转录组等项目共计 完成近万个样本的测序与分析服务
  • 累计协助客户发表权威SCI论文总IF超过 160分
  • 512核心CPU,1T内存 满足大规模并行的,敏捷的数据分析服务;
  • 1PB 数据磁盘阵列保证企业级 测序分析结果存储的安全稳定

官方网站: www.biogenius.cn 
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