RSAM-05 de novo 转录组拼接

本方案的研究目的是在没有参考基因组情况下完全依据单端或双端RNA测序数据重构转录本和基因。目前，对于无参考基因组的转录组数据可以应用该方案完成转录本的鉴定重构，并结合转录本的功能注释完成新物种转录组研究。该方案可以配合表达量计算，可变剪接分析，以及差异表达分析等分析模块共同探索新物种的转录组。 
 

图例 de novo 拼接采用graphics图算法实现 
 

图例 从头拼接转录组可以识别出转录异构体

从头拼接转录组在不同物种中采取的数据量会决定转录本表达量与对应转录本覆盖度百分比：
 

更多详情：http://www.biogenius.cn/htm/products/transcriptome/rnaseq/analysis/310.html


 

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