8道毛细管3500系统和24道毛细管3500xL系统，升级了导热系统设计，满足DNA片段分析对温度控制的要求。
505nm单波长固态长寿激光源，标准电源供电，信号强度一致性显著改善。
强大的数据采集和初步分析软件，实时评估数据质量。
使用RFID技术追踪消耗品数据并记录管理信息。
多色荧光分析能力，可进行多种荧光染料的检测。
毛细管阵列和聚合物分离胶通用，操作简单便于维护。
AppliedBiosystems3500和3500xL基因分析仪包含毛细管电泳仪、毛细管阵列和高分子分离胶、DNA测序和/或片段分析系统专用试剂和耗材、Dell计算机工作站和液晶显示器、整合软件
AppliedBiosystems提供3500系列系统消耗品，毛细管阵列提供36cm和50cm长度，支持多种应用和运行方法，针对多种应用进行优化并简化用户选择至与上一代36cm阵列相似的运行时间。3500和3500xL毛细管阵列定制进样160次。