产品描述
无限未来的创造者————真菌基因组
真菌基因组研究，是通过基因组测序和组装获得真菌全基因组序列，并对其进行结构和功能研究的方法。依据研究目标所需精细程度的不同，我们提供了真菌框架图、精细图和作为真菌精细图前置的真菌Survey三种不同的解决方案。对这些菌株的深入研究，也让我们能够更好的了解和利用真菌资源，创造出更大的价值。
多样化基因组解决方案
多平台的选择，不同精细程度的真菌基因组测序方案，适用不同研究背景，为您量身定制最适宜的真菌基因组解决方案。
| 产品 | 测序平台 | 测序策略 | 组装指标 | 适用范围 | 项目周期 |
| 真菌Survey | Illumina PE150 | 350bp文库 ≥ 100X | 无 | 估算基因组大小 评估组装难度 | 30个自然日 |
| 真菌框架图 | Illumina PE150 | 350bp文库 ≥ 100X | 无 | 大量菌株 框架测序 | 45个自然日 |
| 真菌精细图 | PacBio | PacBio文库 ≥ 70X 350bp文库 ≥ 20X | 基因组<100 Mb CN50*≥1 Mb; 基因组≥100 Mb CN50*≥500 Kb | 少量个体 精细组装 | 90个自然日 |
科学方案设计
从材料选取，建库测序，到数据分析，每一步都需要科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果。
信息分析
分析内容=标准分析+高级分析。
不同精细程度的真菌基因组信息分析，解密真菌的发展历程，探究其潜在价值。
| 研究领域 | 具体内容 | 作用 |
| 基因组组装 | 基因组组装及结果评估 | 组装获得高质量的基因组序列 |
| 基因组结构研究 | 编码基因预测 | 多种预测途径获得可靠编码基因信息 |
| ncRNA预测 | 预测非编码RNA结构 | |
| 重复序列分析 | 分析基因组重复序列结构 | |
| 基因基本功能注释 | 常见功能数据库注释 (NR、GO、KOG、KEGG 、Pfam 、SwissProt、TCDB、CAZy) | 通过常见权威数据库解释编码基因功能 |
| 菌株致病相关研究 | 病原与宿主互作（PHI）、分泌蛋白、次级代谢产物基因簇、 细胞色素P450、真菌毒力因子（DFVF） | 从胞外分泌、宿主互作等机制解释菌株致病性 |
深入到位的数据挖掘
不论是个体深入变异解析，还是群体进化历史解读，我们都有完备的解决方案，为您解决关心的生物学问题。
| 研究目标 | 应用技术 | 解决问题 |
| 个体深入变异解析 | 基因组间共线性分析 | 基因组一对一共线性比较寻找基因组间同源序列 |
| 基因组间变异检测 | 以共线性区域为基础全面解析基因组间变异信息 | |
| 群体进化历史解读 | 基因家族构建 | 基于MCL算法精准聚类单拷贝基因用于进化分析 |
| 进化树构建 | 构建菌株间进化关系解析菌株起源传播规律 |
悦读高质量测序数据，尽享HPC澎湃动力
真菌基因组测序采用先进的Illumina、PacBio测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台（High Performance Computing，HPC）采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合，实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展，高性能计算平台将会持续更新并扩容，以保证高效的数据处理和安全的数据存储。
出色完成每一个项目环节
诺禾致源微生物客户遍布全球，截止2017年12月，已发表20余篇微生物文章，单菌完成样品数超过20000个，项目合作领域涵盖了动植物致病菌、工业菌、益生菌、环境菌株等广泛领域。
“科学的方案设计，严格的质控管理，专业的分析团队，丰富的项目经验，优质的项目服务”
确保每一个环节都能出色完成，助力科学研究。
