宏基因组学 (metagenomics) 是一种以特定环境样品中的微生物群体基因组为研究对象。通过对环境样品中的total DNA进行高通量测序，用以研究微生物多样性、种群结构、进化关系、基因功能等。 

技术路线 ： 

基因组DNA，样本总量≥3 μg，样本浓度：≥50 ng/μL

测序策略：HiSeq PE150，推荐测序数据量：5G clean

项目周期：45-60个工作日

生物信息分析内容：

1、数据质控；

2、序列组装；

3、基因预测及非冗余基因集构建；

4、非冗余基因集功能注释(Nr注释、COG功能注释、KEGG代谢通路注释等)；

5、基于SSU序列或直接基于reads binning物种分类统计；

6、基于非冗余基因集或者直接基于reads binning功能构成分类统计；

7、基于多样本物种组成多样性分析(Alpha多样性分析、Beta多样性分析以及LEfSe分析等)；

8、优势物种的基因组独立分析