CapitalBio mRNA 表达谱芯片检测
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CapitalBio mRNA 表达谱芯片检测

产品属性

  • 品牌博奥晶典
  • 产地北京
  • 型号CapitalBio mRNA 表达谱芯片检测
  • 关注度81
  • 信息完整度
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产品描述

CapitalBio mRNA 表达谱芯片检测

简介 

  博奥基因表达谱微阵列服务包括多种预制芯片服务和根据客户自有序列、cDNA 克隆或其他已发布序列设计制作的个性化定制芯片服务。作为亚洲唯一一家入围美国FDA组织实施的芯片技术质控实验项目(MAQC)中,博奥生物的实验结果准确、可靠,主要参数都达到国际同类芯片平台技术水准。2006年8月,博奥生物被英国Nature杂志评选为全球知名微阵列产品和服务供应商。


实验流程 

CapitalBio mRNA 表达谱芯片检测的大体流程如下:

    


技术优势

高灵敏度,高特异性:表达谱芯片采用70mer寡核苷酸长探针设计,经序列优化、Tm值优化和mRNA3’端倾向性优化。相对于cDNA芯片,这个长度的寡核苷酸探针既可以产生足够的杂交信号强度,又能有效减少非特异性杂交的产生,可用于分析具有一定同源性的基因家族,区分不同家族成员。


标记方法优化:真核生物mRNA芯片标记方法,经博奥生物优化,采用高保真的线性体外转录方法对RNA进行扩增(Eberwine法),然后经cRNA反转录后再进行 cDNA荧光标记,实现DNA-DNA杂交方式(相对于RNA-DNA杂交,DNA-DNA杂交特异性更高,检测更准确)。该方法虽然成本较高,所需时间较长,但有效地实现低丰度RNA的扩增和检测和各个环节的质控,得到高质量的杂交结果。


双通道芯片检测,可以发现更微小的表达差异,并有效地控制实验批次差异:在双通道配对方式(pair- wise)实验设计中,相互比较的两个样本分别标记不同荧光,杂交在同一张芯片上,在每个探针点上两个样品的核酸相互竞争杂交。相对于单通道芯片,双通道杂交能更有效发现RNA表达差异。同时,由于每次检测都是两个样品RNA丰度间的比较,可以有效控制由于芯片制备、标记和扫描引起的实验批次效应 (batch effect),相对于单通道芯片杂交方式具有一定优势)


规范的而深入数据分析和注释:芯片数据按照MIAME (Minimum Information About a Microarray Experi ment)规范提供给客户,方便进行GEO等数据提交工作;采用成熟且得到广泛认可的数据分析方法,便于数据分析方法的可接受性;博奥生物开发的分子功能注释系统(molecular annotation system, MAS)界面友好,分析功能强大,方便客户生物学意义的挖掘。


深入而广泛的服务:博奥生物可以提供从实验设计、样品处理、芯片检测、数据分析、生物信息挖掘等全方位的系统服务,为客户科研项目实施,芯片数据结果解释,GEO数据提交,甚至论文整理提供帮助


产品信息

物种产品编号芯片名称探针数目
220010晶芯人类全基因组寡核苷酸微阵列芯片V1.022,000
220011晶芯人类全基因组寡核苷酸微阵列芯片V2.035,000
220110晶芯人信号传导寡核苷酸微阵列芯片906
220120晶芯人细胞因子和炎症反应寡核苷酸微阵列芯片471
220140晶芯人细胞凋亡寡核苷酸微阵列芯片374
220150晶芯人神经生物学寡核苷酸微阵列芯片198
220180晶芯人细胞周期寡核苷酸微阵列芯片102
220190晶芯人DNA损伤和修复寡核苷酸微阵列芯片101
220210晶芯人肿瘤相关基因寡核苷酸微阵列芯片2,747
小鼠221011晶芯小鼠全基因组寡核苷酸微阵列芯片32,000
大鼠221120晶芯大鼠全基因组寡核苷酸微阵列芯片27,000
221710晶芯狗全基因组寡核苷酸微阵列芯片25,000
果蝇221610晶芯果蝇全基因组寡核苷酸微阵列芯片15,000
家蚕221210晶芯家蚕全基因组寡核苷酸微阵列芯片23,000
拟南芥221410晶芯拟南芥全基因组寡核苷酸微阵列芯片29,000
棉花224110晶芯棉花cDNA微阵列芯片V1.012,000
224112晶芯棉花cDNA微阵列芯片V2.029,000
白色念球菌222020晶芯白色念球菌全基因组寡核苷酸微阵列芯片8,000
酵母222010晶芯酵母全基因组寡核苷酸微阵列芯片6,400
大肠杆菌221510晶芯大肠杆菌全基因组寡核苷酸微阵列芯片9,300


博奥生物有限公司生物芯片北京国家工程研究中心

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